之間的空間通道予以封閉，盤古大帝也終是因此而耗盡神力化入虛空。
經此之後，三界之間再無往來。哪怕神人實力再強，也無法干涉到另兩界中的事情，而唯一透過空間通道的方法就是經過修煉達至飛昇之境。人間界的修真者達至修煉極限可飛昇至紫府上界，而上界的仙人達至修煉極限則可破開虛空來到完神天界。
如此過了不知多少年月，完神天界之中的兩位玉清神人，水神共工以及火神祝融為獲人間界凡人香火供奉一事而結下不解深仇，一場惡鬥持續九天九夜，水神共工終是不敵敗北，羞憤之下失卻理智，竟是一頭將那三界支柱不周山撞倒，三界噩夢就此衍生。
三界支柱如今一倒，眾生受難……此為天命之劫。
隨著不周山倒下的同時，三界縫隙之中倏然生出一個吞噬萬物的巨大黑洞，不斷蠶食著三界內所有的一切，便是連那些身具大神通、大法力的仙人神人也無一能夠對付得了此物。尤其是人間界，由於盡是凡人居多，所受災禍也最為巨大，眼看生靈塗炭，人間界即將被毀。
當時三界至高之位上的神王女媧終是不忍，不惜化身為妖形，耗損修煉了億萬年的生命元力強行破開三界通道，使之再行恢復往昔，終是下凡來到人間界，用那完神天界帶來的五彩神石，施展大神通將黑洞煉化，女媧也因為妖化之後修為大減，加之又是耗損大量生命元力，在煉化黑洞之後化塵與土，形神俱消。
人間界終於逃過了一劫，紫府上界同那完神天界也是風波漸平。可誰又曾想到，神王女媧煉化了黑洞之後，那黑洞並未就此消失，反倒是在五彩神石的影響下衍生一個獨立於三界之外的全新空間，一個充斥著黑暗邪惡之力的奇異界域；一個正在漸漸成形的妖魔界。首次天命之劫至此完結，但冥冥之中似又是在預演著另一場天命之劫的序幕……
又是得過千年，完神天界出了一名桀驁不遜的逆天神人，是為刑天，此人生性暴虐，漸入魔道。因與繼承女媧神王之位的黃帝起了爭執，竟是欲要挑戰諸天神佛，誓要一統三界做那無上之主。
一場大戰自是難免，不但在那完神上界之中刑天激戰黃帝，紫府上界中的仙人亦是分為兩撥，各自或忠於刑天，或忠於黃帝，連綿惡鬥不絕。人間界中也是如此，戰事頻起，只為刑天與黃帝之爭。
此戰波及三界，仙凡神均是牽扯其中，三界烽煙燃起，血流成海，歷時十數載。黃帝與刑天約戰常羊山，力斬其首，本以為三界就此安寧，何曾想刑天魔功大成，竟是不死，復又昂然起身，以乳為目，以臍為口，操干鏚以舞，兇威震天，眼看黃帝都是不敵。
一直隱於完神天界，超脫一切的三清尊神、西天如來得見刑天魔威，終是趕來出手相制，助黃帝將其誅滅。卻不想刑天肉身雖滅，魔心不熄，三界再無可去之地，他毅然將元神遁入那充斥黑暗邪力的魔界之中，而死心追隨刑天的仙凡之輩也是義無返顧的投身妖魔界。
至此混沌天地又是真正多出了一個嶄新界域——妖魔界。由於刑天失卻肉身，又是被黃帝大傷元氣，遁入妖魔界後便休生養息，蟄伏積蓄，諸界終是得以安寧。二次天命之劫因三清佛祖大能而渡，可諸界安平又能維持多久呢？
經刑天與黃帝一戰，完神天界之中死傷神人無數，黃帝隱退，傳位於昊天金闕至尊玉皇大帝，由三清尊神輔佐之，以期再興完神天界，引出封神之戰……
時值人間百廢待興，紂王當權，原始尊者賜愛徒姜子牙持封神榜下凡來到人間，為三界興替演化因果。
紂王本非無道，只是那妲己妖媚惑主，把持朝綱，終是引來諸侯不滿，神州大地戰禍紛起，姜子牙順應天命輔助周朝，請來人間修真者乃至上界仙家下凡助力，使得原本處於劣勢的周朝反倒是高歌猛進，長驅直入朝歌，