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孫元起知道此時已經事不可為，便取出自己的存錢，大約兩千多兩銀子，開始未雨綢繆。
先分出四百兩給老趙和老鄭，囑咐他們出去買糧食和各種生活用品。這戰亂一起，誰知道什麼時候結束？戰亂可以曠日持久，但肚子卻不能一日空著。尤其是這個院子裡有十多口人，“手中有糧，心中不慌”。所以，當務之急是準備好糧食和各種日用品。；
老趙從來沒見過那麼多錢，說話都結巴了：“先生，這些銀票，可買不老少糧食呢，都夠俺們吃三四年的啦！一口氣買那麼多，只怕存不住，黴爛了！”
孫元起也不解釋，只是讓他不用擔心，儘管買就是。
接著，把自己的一些緊要東西收起來，有些就直接在書房裡挖個大坑，埋了進去。上面再擺上書架。自春節以來，孫元起給自己院子裡學生的上課速度明顯加快，編書速度也提速不少。一方面，學生少，有問題也可以迅速解決；一方面，日子也在漸漸變長，上課時間跟著加長，學生自然無話，學生家長更是歡欣鼓舞，認為孫先生是盡心盡力。只是這樣，忙了編寫教材的學生。不過，加上崇實中學新來的學生，人多力量大，倒不是太苦。到了農曆四月底（西曆5月底）的時候，小學堂的各科教材已經編到五年級上學期，而《中等物理教科書》、《中等化學教科書》、《中等數學教科書》第三冊已經編完，著手編著第四冊了。孫元起用拍電報的方式通知商務印書館，讓他們儘快來取。
等這些都忙完了，孫元起先去拜訪丁韙良先生。
果然，一見面，丁韙良就開始向他抱怨“那夥暴民”殺害傳教士，毀壞教堂，攻擊教徒的卑鄙行徑，並嚴厲譴責中國地方政府對於這種野蠻舉動的不作為，希望清政府能夠給予暴民應有的懲罰，以保障教民的人身和財產安全。
孫元起對於這個嘮叨的老人能有什麼辦法？總不能在他面前斥責這些傳教士對於中國地方事務的干涉，以及他們的為非作歹吧？等他嘮叨完畢，才表面自己的來意：希望他積極關注義和團的動向，以免受到人身傷害。
丁韙良一方面感謝孫元起的幫助；另一方面，則表示不用擔心，因為他屬於美國僑民，美國公使館會給予幫助，同時，他又是清政府的高階官員，可以得到中國人的協助。這樣，還有什麼可擔心的呢？
孫元起心裡苦笑了一下：等到戰亂一起，各國公使館自顧不暇，皇帝、太后也被人攆得如同喪家之犬，如何顧及你？
等到告辭的時候，出於好心，孫元起還是再次提到自己的來意。至於那個嘮叨而倔強的老頭到底能聽進多少，那就得看他的那位上帝怎麼安排了！
第二天，孫元起又去美國公使館拜訪康格先生一家。
很顯然，在這個暴風雨到來之前的平靜中，康格先生非常忙，因為在和孫元起見面的時候都沒有握手，他正在批閱一份檔案：“對不起，york，請隨便坐。我實在是太忙了，有一大堆該死的事情需要緊急處理！”
“應該說‘對不起’的是我，請原諒我的冒昧來訪。”孫元起隨便找個地方坐下來，“我想我不會耽誤您太多的時間。”
“好的，york，你說吧，我在聽著呢。”康格先生頭也不抬，彷彿已經埋沒在檔案的海洋中了。
孫元起決定開門見山：“首先，是想提醒你關於義和團的事情，義和團，就是——”
“你不用解釋，我知道什麼是‘義和團’。你瞧，我面前這一堆檔案，都是傳教士和僑民發回來的求助信！這群暴民簡直要毀了一切——對不起，york，我不是要詆譭你們同胞，你明白我意思的。”康格扭了扭酸澀的脖子，抱怨道。
“即便如此，我還是提醒你，對義