著一腔忠心被指為攝政王，難免引來眾多不滿。博果爾自己也有些手忙腳亂，以前博果爾在議政王大臣會議中獻策並不多，一來是為了明哲保身，二來他確實也不太懂。但現在不行了，兩個攝政王，四個輔臣，每天都要一起對繁重的國事進行處理，再無可以推諉的理由，反而因為博果爾的年輕無功績，他更加要努力工作，才不會讓人背後笑話。
但事情卻沒有就此明朗起來，第一個給他惹麻煩的是他的異母兄長：察哈爾親王阿布鼐，在所有的蒙古貴族們悉數進京為順治奔喪時，他卻依然呆在察哈爾，無動於衷。因著眾所周知的原因，每一個人都在等著看攝政襄親王的表現。博果爾氣惱之至，阿布鼐這是冒天下之大不違，愚蠢地把自己樹立成一個靶子，他提議立即派人去把察哈爾宣旨，數其罪，罷其爵，再將他帶回監禁。這當然是不可行的，不說察哈爾會不會接旨，會不會因此而生反叛之心，以阿布鼐的一貫習性，他即便接了旨也不會執行，何況馬喀塔公主還在世，也不能不給她面子。此事最後不了了之，博果爾雖然因為這個表態在朝廷上立住了腳，在家裡卻很受了皇貴太妃一頓怒罵。博果爾很無奈，他知道皇貴太妃的意思，兩兄弟他如果再不幫阿布鼐說話，還有誰會幫，可他處在這個位置，有些事不得不做，而且這絕對不是阿布鼐的最後一次犯渾，終有一日，他定會落到像博果爾所說的那種下場。貴太妃聽了也頹然了，兩個兒子如果發生爭執，她到底應該偏向誰？
立住腳並不代表著說話算數，努力也不代表著能一步到位。本來，攝政即替君執政，代行皇權，攝政王能獨自處理軍國大政，並以皇帝的名義頒發諭旨，體現自己的意願。但在經過了多爾袞的挾權自重後，朝中眾人均對新任的攝政王嶽樂與博果爾側目不已，十分警惕，更別提還有四位輔政大臣虎視眈眈。博果爾雖從未想過大權在握，但既然機會來了，他也不會往後縮。他是這麼想的，不代表嶽樂有同樣的想法，同時身兼攝政王與議政王的嶽樂沒有勇往直前，反而卻縮將了起來，除了日常政務上，凡有分歧或需要作決策時他總是裝聾作啞，息事寧人。兩個攝政王一個有心無力，一個有力無心，一步步地被邊緣化，漸漸的四大輔臣說話份量更重了一些。
而四大輔臣中，索尼已年老體衰，遏必隆軟弱無力，鰲拜卻是年富力強處事果斷之人，蘇克薩哈雖然能遇事力爭，但遠不是鰲拜的對手，於是朝務如前世一般，慢慢地落入了鰲拜之手。博果爾重生一世，若不作些改變豈是枉費了那三百年？他竭盡全力與鰲拜周旋起來。
博果爾與鰲拜的第一次交鋒源於康熙元年初的“遷海令。”
順治十八年，鄭成功從荷蘭人手裡收復臺灣，未有根據地的鄭軍就已經令清軍大為傷腦筋，更不用提已經有了臺灣作後盾的鄭軍了。康熙元年，為防內地民眾與鄭成功抗清勢力聯絡，鰲拜竟提議從山東省至廣東省沿海的所有居民內遷50裡，並將該處的房屋全部焚燬，以及不準沿海居民出海的措施。
博果爾極力反對，他知道這項措施可暫時防禦鄭成功的進攻，可這是一項飲鳩止渴的措施，沿海地區的民生將被完全破壞，由此而帶來的後果將十分嚴重，日後的閉關鎖國政策均由此而生，到了二百多年後，大清的海面上將讓蠻夷的軍艦橫行而無招架之力。他認為，面對鄭成勸的進攻，退縮是沒有用的，只有壯大自己的實力，才有可能戰勝鄭成功。
可惜，博果爾孤掌難鳴，即使他是一個所謂的攝政王，卻依然不能與眾多臣子相抗衡。博果爾只好暫退一步，堅持了自己的底線，即使要隔斷鄭成功與大陸的聯絡，也沒必要波及至四個省，單禁福建一省已足夠。
見事情僵持住了，嶽樂終於頂不住壓力，出面調停，遷海令依然釋出實施，但暫限於福建一省，見是否有實效後再另作商議。