第一集：渾濁世道中的清流 在明朝嘉靖年間，大明朝的朝堂和民間都瀰漫著一股烏煙瘴氣的氛圍。皇帝朱厚熜一心痴迷於修道，妄圖求得長生不老之術，他將大量的人力、物力投入到道觀的修建和煉丹之事上。朝堂之上，嚴嵩父子把持朝政，他們結黨營私，貪汙受賄，賣官鬻爵，將整個官場攪得渾濁不堪。
在這樣的世道下，海瑞，一個小小的淳安縣令，卻宛如一股清流。海瑞自幼家境貧寒，但他飽讀詩書，深受儒家思想的薰陶，立志要做一個清正廉潔、為民請命的好官。淳安縣，本是一個貧窮的小縣，百姓們飽受苛捐雜稅和貪官汙吏的盤剝。海瑞到任後，立刻開始了他的改革。
他先是重新審查了縣裡的賦稅賬目，發現前任縣令與當地的豪紳勾結，多收賦稅，中飽私囊。海瑞毫不留情地將那些豪紳召集起來，義正言辭地告訴他們必須按照朝廷規定的數目繳納賦稅，並且要補繳以往多收百姓的部分。豪紳們起初並不把海瑞這個小小的縣令放在眼裡，他們妄圖用賄賂和威脅的手段讓海瑞就範。
有一位當地最富有的豪紳，帶著一箱金銀珠寶來到海瑞的縣衙。他滿臉堆笑地對海瑞說：“海大人，這是小小心意，還請大人高抬貴手，以後在這淳安縣，大人有什麼需求，小的一定全力滿足。”海瑞看了一眼那箱珠寶，面色冷峻地說：“本縣令只接受朝廷俸祿，這些不義之財，你還是拿回去吧。你若是能將多收百姓的錢財補繳，本縣令可以既往不咎，否則，本縣令定當按照律法嚴懲。”豪紳見海瑞不為所動，臉色一變，威脅道：“海大人，你可不要敬酒不吃吃罰酒，在這淳安縣，還沒有我辦不成的事。”海瑞猛地站起來，大聲說道：“本縣令為官一任，就是要為百姓做主，你若是敢在本縣胡作非為，本縣令定不饒你。”豪紳只得灰溜溜地帶著珠寶離開。
海瑞不僅在賦稅上進行改革，還十分關心百姓的生活。他經常微服出訪，深入到百姓家中，瞭解他們的疾苦。他發現淳安縣的水利設施年久失修，一旦遇到洪澇或乾旱，百姓的莊稼就會顆粒無收。於是，海瑞親自帶領百姓們修繕水利工程。他和百姓們一起挑土、築堤，百姓們都對這個縣令充滿了敬意。
在海瑞的治理下，淳安縣逐漸有了生機。然而，他的這些行為卻觸動了一些人的利益。嚴嵩父子在朝中得知有這麼一個不識時務的縣令，決定給他點顏色看看。他們指使浙江的布政使，以各種理由削減淳安縣的財政撥款，還妄圖找藉口撤掉海瑞的官職。但海瑞並沒有被這些困難嚇倒，他一方面緊縮縣衙的開支，一方面鼓勵百姓們自力更生。他對百姓們說：“只要我們齊心協力，就不怕那些貪官汙吏的刁難。”
在這個渾濁的世道里，海瑞就像一盞明燈，雖然微弱，但卻堅定地燃燒著，為淳安縣的百姓照亮著前行的道路，而他與黑暗勢力的鬥爭才剛剛開始。
第二集：應天風雲起 由於海瑞在淳安縣的出色表現，他的名聲漸漸傳到了京城。雖然嚴嵩父子對他恨之入骨，但也有一些正直的大臣對他十分讚賞。不久後，海瑞被調任為應天巡撫。
應天地區，是明朝最富庶的地區之一，同時也是官場腐敗最為嚴重的地方。這裡有大量的豪強大戶，他們與官府勾結，肆意欺壓百姓。土地兼併現象極為嚴重，許多農民失去了土地，淪為流民。
海瑞到任後，沒有絲毫的懈怠。他深知土地問題是應天的根本問題，於是決定重新丈量土地。這一決定如同在平靜的湖面投下了一顆巨石，立刻引起了軒然大波。那些豪強大戶們紛紛反對，他們透過各種關係向海瑞施壓。
徐階，曾經的內閣首輔，他在應天擁有大量的田地。他的家族子弟在當地橫行霸道，魚肉百姓。當他得知海瑞要重新丈量土地時，他先是寫了一封信給海瑞，信中以長輩的口吻勸說海瑞不要輕舉