被部將也速迭木兒襲殺。
也速迭木兒是元世祖忽必烈之弟阿里不哥的後裔，阿里不哥與忽必烈爭汗位失敗被殺。
也速迭木兒為了報百年之仇，乘脫古思帖木兒戰敗之機，聯合西蒙古，攻佔了和林，然後引兵東向，在土剌河與脫古思帖木兒狹路相逢。
黃子澄說，藍玉與也速迭木兒互通情報，合夥滅了脫古思帖木兒，兩人惺惺相惜，約定\"我主北，君主南，共有天下\"
黃子澄還說，藍玉被貶岷州西北邊陲，心懷怨恨，要防備他叛逃蒙古，投奔也速迭木兒，然後引蒙古兵南下。
黃子澄這一招不可謂不毒，朱元璋內心潛藏已久的猜忌又被重新勾起。
當初藍玉孤軍深入，進至距捕魚兒海四十里的百眼井，派哨騎四處偵察，不見北元軍隊蹤跡。
當時風沙滿天，糧草斷絕，數萬人連飲用水也短缺，眾將心灰意冷，要求班師。
藍玉異常篤定，命令大軍往捕魚兒海東北方向進軍。
脫古思帖木兒正在宮賬中睡大覺，被藍玉殺了個七零八落。
在沙漠中打仗，最要緊的是確定方向。
藍玉是如何在茫茫大漠中撞見脫古思帖木兒的？
要麼有神仙指路，要麼他就是神仙，不然就是有人給他通風報信，而這個人就是也速迭木兒。
作為回報，藍玉放跑了脫古思帖木兒，留給也速迭木兒報仇。不然怎麼解釋脫古思帖木兒從十萬大軍的包圍圈中逃脫？
朱元璋一番腦補，成功破案。
朱標連忙替藍玉辯白，\"黃子澄一介書生，是如何知道遠在萬里之外的機秘事的？兒臣逐字逐句看了他的奏疏，字裡行間充滿了毫無根據的臆測。如果他對藍玉的指控是有真憑實據的，他為什麼不拿出來？\"
朱元璋卻道:\"黃子澄只是翰林院一個侍講，就算藍玉真的私通也速迭木兒，黃子澄也不可能拿得到證據。\"
朱標:\"既然黃子澄沒有拿到證據，那憑什麼相信他的彈劾？\"
朱元璋:\"所以要召藍玉回南京，接受三法司的問詢啊，咱又沒有聽風是雨給他定罪。\"
朱標太瞭解藍玉的個性了，如果將他召到南京來，絕對會惹出天大的事端，道:
\"王弼當時是左副將，參與了捕魚兒海之戰的全程，父皇何不召他來問個究竟？\"
朱元璋:\"誰不知道王弼跟藍玉好的穿一條褲子？問王弼和問藍玉有什麼兩樣？\"
朱標聞言，徹底無話可說，憤然而去。
朱允熥冊封在即，萬萬沒想到半路上殺出來一個程咬金。
他的處境極其尷尬，他既不能替藍玉辯白，也不能不替藍玉辯白。他因為與藍玉的關係而受到淮西將領毫無保留的擁戴，藍玉卻因為與他的關係而受到朱元璋的疑忌。
他已經猜到了，黃子澄背後的主謀必定是朱允炆，誣告藍玉的目的就是為了阻止他冊封皇太孫。
朱標也是這麼想的，語氣極其嚴厲地問朱允炆:
\"黃子澄是不是你指使的？如果是，趕緊向爺爺坦白承認。如果被我查出來，不說取你性命，最少也要將你從玉牒中除名！你這是在為了一己私利而禍亂國家，將會血流成河！\"
朱允炆指天指地賭咒發誓。
朱標又問:\"就算不是你主使的，黃子澄與你過從甚密，事先就沒跟你透過氣嗎？\"
朱允炆想起十二月二十八日黃子澄在東角門跟他說的話，現在想來，那就是在通氣。
但他現在打死也不敢承認，只能硬著頭皮反問:
\"黃子澄為什麼要和兒臣通氣？黃子澄是大本堂的師傅，是皇祖指定的，有傳道授業的職責