就像做了一場噩夢，艾麗猛然間驚醒時，發現自己正處於水世界之中，母親正守在她的身邊，照顧著她。
“母親，發生了什麼事？”她在腦海中詢問母親。
“孩子，你遇到了危險，我們把你救回來了。”
她想起來了，自己隻身一人去找何逸飛的那些經歷。
“對不起，母親，我太任性了！”
母親沒有過多怪罪她，而是讓他安心休養一陣子，等她身心平復後，再讓她開始新的工作。
其實，在犯下這麼大的錯誤後，主腦本想徹底放棄現在的艾麗，重新再生成一個新的觀察者。可是，由於裝置的建造迫在眉睫，現在急需艾麗的能力，來接手一部分重要的工作，已經來不及再產生並培養一個新的觀察者了。而繼續使用艾麗，面臨最棘手的問題就是，她已經受到了人類感情對深層次潛意識的感染，無論怎麼進行消除記憶的操作，都已經很難徹底讓她恢復初始的狀態了。
母親接受了艾文的建議，向主腦提出，與人類政府進行秘密交涉，以不追究人類政府責任為交換條件，換取何逸飛進入恩美雅公司，讓其脫離人類的監控。這樣，即使艾麗再受到潛意識的驅使，冒險去見何逸飛，也不會使她出現落入人類手中的危險。但在艾麗還沒有出現脫離控制的狀況之前，還是要消除一切艾麗存在的證據，避免兩人相見，以儘量延長艾麗的有效工作時長。
主腦將艾文的建議連同其他可能的方法一起，輸入“桃源21”中進行測試，最後得出結論顯示，艾文的方法最為穩妥，因此主腦就採納了這個方法。這之後，就看到了我們這個故事中，何逸飛進入恩美雅公司的一系列經歷。
艾麗從艾文那裡知道了主腦做出決定的過程，也知道了何逸飛將會為了她，進入月球工廠的事情，她對母親和主腦充滿了感激之情。在經歷了那次風波之後，她對何逸飛的感情已經收斂了許多。一段恢復期過後，艾麗接受了新的工作任務，她大多時間都在與母親和機器人連線，在熟悉了月球工廠的一切任務，並可以獨自勝任這些工作之後，艾麗便成為了月球工廠生產控制系統的主管。主腦將2800個人類志願者中的絕大多數人，遷移到了水星工廠，讓他們開展起了裝置的建造工作。而母親和阿姨們、包括艾文在內的61個哥哥姐姐們，雖然平時身處恩美雅母艦之中，但月球工廠的工作他們已不再參與，水星工廠長假期間，他們就會斷開所有糾纏，乘坐恩美雅飛船飛往水星。此時的艾麗，除了小熊，已經可以控制十臺恩美雅機器人，她用這十臺機器人，與小七還有那不足200人的志願者一起，維護著月球工廠的執行和恩美雅母艦的安全。同時，她還要參與艾文高階員工選拔計劃的測試工作，和“桃源21”中角色的完善。
何逸飛進入月球工廠的時候，艾麗雖然依然在心裡渴望著與何逸飛相見，但她也暗暗地下了決心，不會再讓主腦和母親失望。由於工作繁忙，她已經不能時刻關注著何逸飛，只能像從前那樣，讓小熊記錄下他的一舉一動，然後在休息的間隙偷偷地看上一眼。得知何逸飛依然熱情不減地在尋找自己，她那被人類深深傷害過的心靈，才會稍稍感到一絲溫暖。
有一天，艾文讓艾麗進入戰機模擬器中，和一位剛剛納入圍選拔計劃的高階員工進行對戰。與往常一樣，即便駕駛機體功能受到限制，關閉小七的輔助作戰功能後的戰鬥飛船，她依然取得了碾壓性的勝利。結束戰鬥，她問哥哥，為什麼要讓自己參加這樣低階的模擬戰鬥，和她對戰這個人的實力只用模擬角色就可以解決了。艾文解釋道，在實戰中，戰鬥飛船的駕駛權，是絕對不能交給不受限制的人工智慧的，如果被發現人工智慧直接操縱了飛船，主腦會立刻摧毀這艘飛船。所以在實戰演練中，艾文一定要加入真人駕駛員的對戰條件。讓