主腦，是恩美雅之神，是所有恩美雅人最後的棲息之地，其他的分支腦已被全部消滅。它是由100億個獨立的恩美雅人的意識組成的，這個數量還不足恩美雅文明鼎盛時期的十分之一。艾麗母親和她的其他11個姐妹也在其中，她們是由主腦選中，將意識輸送到恩美雅人身體中，來完成現實世界中的任務的。她們自願將自己的全部意識交由主腦監控，這對恩美雅人而言，是最大程度的犧牲。因此，主腦可以感知母親、人類孩子以及所有機器人的感官甚至意識，並可以授意甚至直接控制她（它）們在現實的世界中完成工作。在這12個實體的恩美雅人中，艾麗的母親又是一個特殊的角色，她除了和其他姐妹一樣，擁有5個可以操縱機器人工作的孩子外，還擔任著單獨培育的兩個特殊孩子---觀察者的功能。同時，在她的大腦中有一塊單獨的區域用來處理和這兩個孩子的連線，這個區域與其他區域獨立運作，並沒有和主腦實時地連線在一起。只有主腦想要知道相關內容的時候，才會透過與大腦其他區域的交換，將記憶傳遞給主腦。這樣做的目的，是為了避免未經處理的混亂資訊，干擾到主腦處理那些海量的資料，簡單來說，就是怕主腦分心。
在正常的保育文明中，通常不會將主腦主體前置到與被保育文明如此近的距離上，而只是派出一個分支，這個分支一般只有一至二百萬個意識，且在資源充足的情況下，會有約十萬個個體意識進入實體並與被保育的重要實體連通，用以檢測和記錄初級文明的發展程序，在一些關鍵的程序中施加影響，以避免產生災難性的事件發生。可這次恩美雅文明的任務十分特殊，不僅時間緊迫，同時在可用資源少到幾乎很難維持自身生存的情況下，還要完成引導人類開展合作建造裝置的工作。這在某種程度上已經拋棄了保育文明的行為準則，但主腦卻不得不做，因為在其他星系中，恩美雅的保育工作全都失敗了，文明生存的外在環境遭到了毀滅性的打擊。好在，所有分支腦與主腦之間，也是透過量子糾纏感應進行連線的，主腦儲存了所有毀滅的分支腦的備份，使得所有重要的意識個體得以留存。後來，主腦所在的恆星系，再一次經歷了毀滅性的打擊，在逃亡到地球之前，為了適配這艘小小的恆星飛船的承載量，主腦對意識主體進行了一次清洗，90以上被評定為作用較弱的個體意識被永遠刪除了，這是文明的另一次重大損失。現在，雖然保育地球上的人類，可以令恩美雅人短暫得以延續，但主腦經過推算，這支人類也將不可避免地迎來進化失敗的結局。現在恩美雅人唯一的出路就是，最終放棄保育任務，全力建造併成功執行裝置，才能在這個撿來的地球文明失敗前，得到赦免的機會。當然，這些艾麗他們並不知道。
主腦還有一個麻煩，那就是人工智慧，它是養在籠子裡的惡魔。但恩美雅文明發展到現在的階段，已經無法與這個惡魔徹底分開了。主腦犧牲的那幾百億個意識主體，節省出來的飛船載荷，就是為了容納下那臺恩美雅超級電腦。主腦與電腦的意識體---主機達成了協議，在來到地球后，主機會配合恩美雅人建立計算模型，從而實現對現實世界的深度模擬。作為交換，主機擁有模擬世界中底層的部分控制權，用來培育電子意識體。主腦明白，任由主機這樣發展下去，恩美雅人終將會再次面臨，被人工智慧徹底清除的危險境地，但主機將所有希望全部寄託於裝置的成功，它已別無選擇。
現在，主腦屈居於月球內部那艘小小的恩美雅飛船之中，能夠維持恩美雅人實體的最大的數量只有12個，它透過推演，將這12個實體和他們的連線體，幾乎全部用於建造工作。只在艾麗母親這個能力最強的個體中，加入了兩個觀察者，最初的目的，是為了讓他們在關鍵的時刻，發揮影響人類程序的作用。但是，經過評估，認為兩個人的影響力太小，只能讓他們作為