大重修城垣，歷時半年。並在南門外又增設一座20丈寬廣的月城（甕城），一座9丈寬的水門（隨著跨河而建的水城的出現，供船舶往來的水門也產生了）。另外還增設了兵馬司庫房、總檯鋪各1座，增設4座箭樓、5座敵樓、38座窩鋪。明代的定海城牆酷似中國七大古城牆之一的平遙城牆。平遙城牆建於明洪武三年（1370），位於山西省平遙縣，周長6公里，高8～10米，底寬8～12米，頂寬3～6米，牆身素土夯築，外壁城磚，白灰包砌。環城闢城門6道，門外築甕城。平遙城牆馬面多，造型美觀，防禦設施齊備，為中國曆代築城之僅有，並以築城手法古拙著稱於世。
五、清代：因兵燹戰火所致城牆大修了五次
清代定海城牆大修了五次，定海城牆屢毀屢建，只是城牆總的格局未變，一直保持到上世紀50年代。
第一次：規模最大的一次築城，是在清康熙二十八年（1689）。
清順治八年（1651），清軍攻佔舟山，“大兵再至，寇遂墮城而去”，城池被戰火所毀。原明軍將領、人稱“陳鐵頭”的湖北利川人陳世凱，在三十年戎馬生涯中以勇猛出名，他在順治十六年（1659）投降清軍後，於康熙二十八年（1689）年底抱病進京請求康熙准許募捐集資，修復定海城牆，結果客死京師。康熙皇帝被其精神所感動，遂同意修城。當時，沿海一帶反清的武裝已被蕩平，康熙二十七年（1688）剛剛恢復定海縣建制。因定海城池殘破，百姓皆住草屋，且無縣署，又乏稅收。康熙在十二月十六日頒旨撥皇銀３１28７兩，建定海城，寧波府知府、同知和定海縣知縣周聖化以及周邊諸縣縣丞、典史、巡檢等，分別被授為總裁、監造、營造、管工各官，周邊諸縣還要提供城磚等築城物資。康熙二十九年（１６９０）四月十六日動工，定海縣知縣周聖化為實際上的總承造官，經１６個月辛勞，於三十年（１６９１）八月十六日竣工，共動支正項錢糧31287兩。新城規模循舊址建築，計周長1216丈，此城高一丈，址廣1。5丈五。羅月城4座，城身48丈。齒狀雉堞（即”女兒牆”）1280個，城堞高四尺18磚厚；7磚寬；堞孔為三磚寬；。設東南西北四門，門上各建飛樓一座，寬1。6丈，深3。6丈，高1。2丈；又建窠鋪三十八座，分佈四門。城南設水門一座，門外圍繞城濠。後在乾隆五十八年（１７９３），英國派出以馬戛爾尼為首的訪華使團，希望用貿易敲開我們這個富庶的東方古國的大門。舟山群島是英國使團進入中國後所到的第一處，舟山總兵派了兵士護衛英使團在城中游覽。城門是英國使團最初踏上中國土地即浙江定海見到的第一種建築。在英國副使斯當東的眼裡：“定海城牆高三十尺，高過城內所有房子。整個城好似一座大監獄。城牆上每四百碼距離即有一方形石頭碉樓。雉堞上有箭眼。除了城門口有幾個破舊的熟鐵炮而外，全城沒有其它火力武器。城門以內有一崗哨房，裡面住著一些軍隊，四壁掛著弓箭、長矛和火繩槍，這就是他們使用的武器。”隨馬戛爾尼同行的有一個畫家叫威廉－亞歷山大，他在中國期間速寫了大量的風景風俗素描稿。在亞歷山大畫筆下，定海城門上掛著綵綢，有馬車和小販進城，城牆外的民房裡，還有婦女孩子扒牆觀望西洋景，一派其樂融融。英國著名建築師、插畫設計家、水彩畫家阿羅姆（1804－1872），他主要借用了威廉－亞歷山大的素描稿，重新畫了大清國的風景風俗，成了一部集18世紀末和19世紀中國地域風景、民俗風情畫之大成。其中《舟山山谷》描繪了臨海建築的有6英里逶迤城牆的定海城，城外是港口、船帆和一座座懸水的島嶼。
第二次：嘉慶十八年（1813）；因城池年久失修，多處坍毀，知縣沈泰籌劃重修，於二十一年正式動工，至二十二年八月