聯盟在星雲危機之後，迅速投入到宇宙危機預警機制的建設和特種部隊的升級計劃中。各個文明紛紛響應號召，派遣出最頂尖的人才與資源，一時間，聯盟總部所在的星球成為了整個宇宙的焦點，科技與智慧的光輝在這裡交相輝映。
宇宙危機預警機制的建設涉及到眾多複雜的技術與系統。科學家們從“星芒號”艦隊帶回的資料入手，開始構建能夠探測到能量異常波動、空間扭曲跡象以及未知機械生物活動的超級監測網路。這一網路將以聯盟總部為核心，向宇宙各個方向延伸，透過一系列分佈在關鍵星系的監測站，實時收集和分析資料。
在特種部隊的升級方面，各文明的軍事專家們齊聚一堂，分享各自獨特的戰鬥技巧與戰術理念。新型的能量護盾技術被研發出來，這種護盾不僅能夠抵禦更強大的能量攻擊，還具備自我修復功能。武器裝備也得到了革新，融合了多種文明科技的能量槍械，可以根據不同的戰鬥場景切換攻擊模式，從強力的單體攻擊到範圍性的群體打擊應有盡有。
與此同時，聯盟對在星雲深處發現的古老遺蹟中的科技線索展開了深入研究。來自不同文明的考古學家、歷史學家和科學家們組成了專門的研究團隊，試圖解讀遺蹟中壁畫和文字記錄背後隱藏的更深層次的宇宙奧秘。他們發現，這個古老文明在進行維度通道實驗時所涉及的一些基礎理論，可能會為聯盟的空間探索技術帶來革命性的突破。
然而，就在聯盟全力發展之際，新的麻煩悄然降臨。在距離聯盟總部較遠的一個星系中，一艘隸屬於聯盟的小型貿易船在執行常規任務時突然失蹤。這艘貿易船負責在幾個友好文明之間運輸重要的資源和科技產品，它的失蹤引起了相關文明的高度關注。
聯盟迅速派遣了一支調查艦隊前往事發星系。當調查艦隊抵達時，他們發現該星系周圍的空間出現了異常的扭曲現象，類似於在星雲危機中遇到的空間扭曲，但規模較小。而且，在附近的一顆星球上，他們檢測到了微弱的能量波動，這些波動與之前在神秘星球上遭遇機械生物時的能量特徵有一定相似之處。
調查艦隊小心翼翼地靠近那顆星球，準備展開登陸調查。就在他們即將進入星球大氣層時，突然遭受了來自星球表面的攻擊。一群新型的機械生物出現在他們的視野中，這些機械生物相較於之前遇到的更加靈活和隱蔽，它們利用星球的地形和特殊的能量場進行掩護，發動突然襲擊。
聯盟艦隊立刻展開反擊，戰艦上的能量武器向機械生物所在的位置傾瀉火力。然而，這些機械生物似乎具備某種干擾能量攻擊的能力，部分能量光束在接近它們時被扭曲和分散。調查艦隊不得不調整戰術，派遣戰鬥機隊進行近距離攻擊，同時利用特種部隊乘坐穿梭機進行地面滲透。
在激烈的戰鬥中，調查艦隊逐漸發現了這些機械生物的一些弱點。它們雖然能夠干擾能量攻擊，但在面對實體武器攻擊時防禦相對較弱。而且，它們之間的通訊似乎依賴於一種特殊的能量頻率，一旦干擾這種頻率，它們的行動就會變得混亂。
特種部隊成功在星球上登陸後，開始深入探索機械生物的巢穴。他們發現，這些機械生物並非自然進化而來，而是被人為製造出來的。在巢穴的深處，他們找到了一些關於製造這些機械生物的科技資料，似乎是某個神秘勢力在暗中研究古老文明遺留下來的科技，並試圖利用這些科技製造出強大的武器和生物，以達到控制宇宙某些區域的目的。
這一發現讓聯盟意識到，星雲危機背後可能隱藏著更為複雜的陰謀。在聯盟全力應對星雲危機時，這個神秘勢力可能一直在暗中觀察，並利用聯盟在探索過程中暴露出來的資訊，進行自己的邪惡計劃。
聯盟總部在收到調查艦隊的報告後，緊急召開了全聯盟大會。各個文