一切始於虛無：
在神奧傳說中，虛無之地出現了一顆蛋，並孵化出名為阿爾宙斯的寶可夢，而後阿爾宙斯建立了宇宙，並且創造出帝牙盧卡、帕路奇亞、騎拉帝納。帝牙盧卡與帕路奇亞擁有掌控時間與空間的能力，而騎拉帝納則有掌控反物質的能力，它存在於毀壞的世界之中。接著，在世界誕生之初，阿爾宙斯創造了亞克諾姆、由克希和艾姆利多，分別代表共存於現代的人類和寶可夢之中的意志、知識與感情。它們存在於今天被稱為立志湖、睿智湖、心齊湖等湖泊的異空間裡，被稱為湖之傳說的寶可夢。寶可夢世界中出現了天冠山一類的地塊，傳說隨著雷吉奇卡斯在陸地間的移動，形成了各個地區，在天冠山周圍形成的是神奧地區。在這場造山運動中，神奧地區的東北部出現了嚴酷山，在其中的岩漿中誕生出席多藍恩。
海陸空的決鬥：
在豐緣地區，固拉多從地底的岩漿中誕生，蓋歐卡在深海的海溝中出現，烈空坐則形成於臭氧層的物質中。烈空坐在臭氧層中盤旋，偶爾也會來到天空之柱休憩。固拉多和蓋歐卡分別擴張著大陸與海洋。兩隻超古代寶可夢終於碰面，帶來了為爭奪在寶可夢世界之初的優勢而進行的激烈戰鬥。烈空坐最終平息了這場戰鬥，並使得固拉多與蓋歐卡回到各自長眠的洞窟中。為了防止兩隻超古代寶可夢再度醒來，硃紅色寶珠與靛藍色寶珠被製造，並保管於送神山。
日與月的開始：
同時，阿羅拉進入初始形成時期，但沒有光明，天邊三隻傳說中的寶可夢出現，索爾迦雷歐、露奈雅拉與奈克洛茲瑪給阿羅拉帶來了光明，隨後奈克洛茲瑪漸漸消失了光，進入沉睡之中，索爾迦雷歐與露奈雅拉也消失在了天邊。
史前冰河世紀：
許多年之後進入了史前時代，並出現了多種存在於那個時期的寶可夢。考古學家已證實這些寶可夢分佈於各個陸地，在今天形成了化石幷包含著寶可夢的遺傳基因。世界上更多地存在其它種類的寶可夢，除了寶可夢之外，寶可夢世界上還出現了人類。在石器時代、冰河時代和鐵器時代，雷吉奇卡斯分別創造了雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇魯，它們藏於豐緣地區，並作為開啟在雪峰神殿雷吉奇卡斯封印的鑰匙。而在伽勒爾地區，雷吉艾勒奇的力量給人們造成了災禍，為了限制它的能力，古代的人們便在它身上安裝了器具。雷吉奇卡斯還曾經試圖用龍之能量的結晶製作雷吉鐸拉戈，但卻因結晶不夠而只製出了它的頭部。古代的人們害怕當有朝一日雷吉鐸拉戈的整個身體都被製作出來，自己的國家會慘遭毀滅，因此便將其封印到了神殿深處。
廣闊的大宇宙：
約年前，無極汰那伴隨隕石降落到伽勒爾地區，扭曲著周圍時空，散發的能量令那裡寶可夢出現極巨化。無極汰那和代歐奇希斯等宇宙寶可夢一樣來自地球以外，側面證明了寶可夢星球以外存在寶可夢生命跡象。
為了吾之所愛：
約3000年前，卡洛斯地區發生戰爭。當時的國王az的寶可夢朋友花葉蒂死亡。az因而開發出了最終兵器。1500年前，最早的文字書寫方式在阿露福遺蹟、阿斯卡納遺蹟和隨意遺蹟出現。考古學家尚不能確定未知圖騰和這種書寫方式究竟哪個最先出現，但顯然它們之間有某種關聯。在此時期，鯉魚王的種群發生突變，成為了最脆弱的寶可夢。約800年前，在臨死之際，哲爾尼亞斯釋放x/伊裴爾塔爾 吸取y了卡洛斯地區的生命能量，之後在森林x/山脈y陷入沉睡。
金銀開始形成：
在700年前的近代，在緣朱市相繼建造了9層高的鈴鐺塔和鍾之塔。兩座塔象徵著寶可夢與人類之間的友誼和共同生活的希望。從塔頂一覽的情景十分壯麗。西邊的是喚醒寶可夢的鐘之塔，而東邊的塔是寶