用一系列手段喚醒了無極汰那，並稱要“保護伽勒爾地區的未來”而獲取無盡能源。後來，主角一行人來到了微寐森林並找到了腐朽的劍和盾。主角與赫普隨即趕往拳關競技場並來到了地下工廠中。主角遇到了洛茲並與他對戰，洛茲在戰敗後闡述了他的理由。在拳關競技場塔頂，丹帝試圖使用精靈球捕捉無極汰那，可惜並未成功。這時，主角與赫普挺身而出，但他們的攻擊對無極巨化後的無極汰那沒有效果。此時，他們想起了腐朽的劍和盾，並拿出了它們，蒼響和藏瑪然特出現並與兩人共同作戰，最後成功擊敗了無極汰那。最後，主角在微寐森林再次與蒼響/藏瑪然特相見，並讓伽勒爾也恢復了和平。
在這之後，帕底亞地區的派帕為了尋找自己長期不露面的母親奧琳博士／父親弗圖博士，與幾名同學：主角、妮莫和牡丹前往帕底亞巨坑，在第零區內發現了被封鎖的悖謬寶可夢。眾人在第零區深處的零區研究所，驚訝地發現之前的博士是ai機器人的事實，真正的博士已經在一年半前因第4觀測站發生的事故過世了。博士ai請求眾人幫忙關閉能夠捕捉不同時間線的寶可夢並將它們呼喚到現代來的時光機，以制止悖謬寶可夢再度被召喚而影響帕底亞地區的生態，但關閉時光機的同時博士ai會因保衛時光機的程式而進入戰鬥模式。在主角擊敗了博士ai之後，樂園防衛程式又接管了博士ai以阻止時光機的關閉，並封鎖了眾人的精靈球，放出了另一隻故勒頓／密勒頓，千鈞一髮之際主角的故勒頓／密勒頓與樂園防禦程式展開對戰，最終恢復正常的ai一方面為了關閉時光機，另一方面也為了實現博士的遺願，決定透過時光機前往古代／未來。
：()寶可夢：無限星辰