（此為劇場版x進化的精要簡潔版，看過的可以只看最後一點挖坑內容。這個蠻好看的，沒看過建議補一補。）
為了更好的管理（統治）數碼世界，世界樹【伊古德拉希爾】制定了［方舟計劃］用來清除數量眾多的數碼寶貝們。
用x程式來篩選出名義上被選中（倖存）的數碼寶貝們，送他們進入提前創造出的新數碼世界。
在這個過程中，大約有98％的數碼寶貝死在了那裡，在災難的末期，數碼世界重生的規則甚至徹底崩潰，死去的數碼寶貝無法變成資料消散，而是成為屍體永遠留在了舊世界的碎片裡。
部分的數碼寶貝成功活到了那個時候，還有少數幸運兒則覺醒了x抗體，變成了更強大的姿態。
但是，不在掌控之中的，遲早是要被消滅掉。以消滅擁有x抗體的數碼寶貝為由，世界樹命令皇家騎士對所有剩餘的數碼寶貝進行清掃，這令正常的數碼寶貝們也視x抗體的數碼寶貝們為災禍。
在整個過程中，世界樹也察覺到了部分皇家騎士起了異心（點名批評紅蓮騎士獸）。為此，他創造了一個天生具有x抗體的實驗體（多路獸），用於研製比普通數碼寶貝更加強大的掃蕩兵器。
好不容易從舊世界中倖存下來，多路獸本以為可以帶著獅子獸的那一份一起好好地活下去，但正常的數碼寶貝卻對於擁有x抗體的數碼寶貝極度排斥。
為什麼我會在這裡？這種地方，誰都不願意接受我……誰也不覺得需要我……這是……為什麼？
在擁有x抗體被視為異端的時候，多路獸只能一隻數碼寶貝不停流浪，在一處沒有數碼寶貝生活的古建築裡安息。
直到一隻戰鬥暴龍獸x在保護迪哥獸與［方舟計劃］的執行者奧米加獸戰鬥時，意外落在了他的附近……
“你也有x抗體嗎？真是辛苦你了……”
這是那麼久以來第一次，有數碼寶貝對多路獸說——辛苦你了……
“作為你的同伴，我有一個請求……”
“同伴？”
也是這麼久以來第一次有數碼寶貝願意將多路獸當成同伴……
“沒錯，你應該明白吧，我也同樣有x抗體，我現在必須回去救其他人，這段時間可以拜託你幫忙照顧這孩子嗎？請保護好這孩子。”
照顧迪哥獸？保護迪哥獸？我能做到嗎？
“沒問題的，相信你一定做得到。”
多路獸答應了戰鬥暴龍獸x，要保護好迪哥獸。在那之後，即使對手是奧米加獸，他也頑強地反抗著。
在一次又一次的撞擊中，那種想要保護的心情，那種想要活下去的想法，動搖著奧米加獸的信念。
為什麼？明明知道他們不堪一擊，我為什麼要任由這些孩子打……
趕來救援的鋼鐵加魯魯獸x擋住了奧米加獸的攻擊，把自己x抗體給了感染了x程式的迪哥獸，救下了迪哥獸和多路獸，死在了多路獸面前。
活下去……帶著我的那一份一起……
在極度的不甘下，多路獸進化成了多路加獸，帶著又一次被他人“贈予”的生命，和一同前來救援的戰鬥暴龍獸x對戰奧米加獸。
“為什麼？為什麼還要戰鬥？”
“為了活下去……我說過了，我要活下去……為了讓生命延續，我要去戰鬥！”
“世界樹……不希望如此……”
奧米加獸猶豫著，但還是遵循著世界樹的命令，想要對兩人出手。在紅蓮騎士獸的阻止下，戰鬥暴龍獸x得以說出有關［方舟計劃］第一階段的真相。
［方舟計劃］早已進入第二階段——消滅所有的數碼寶貝。這樣的決定，超出了紅蓮騎士獸所能接受的範圍。