孫仲： 《三國演義》虛構黃巾將翎。和韓忠、趙弘共同攻宛。與朱雋、劉備交戰，被劉備射中落馬。
黑山軍：黑山、黃龍、白波、左校、郭大賢、於氐根、青牛角、張白騎、劉石、左髭丈八、平漢、大計、司隸、掾哉、雷公、浮雲、飛燕、白雀、楊鳳、於毒、五鹿、李大目、白繞、畦固、苦唒
張牛角： 博陵（今河北定州）人，隨黃巾起事，號將兵從事，與張燕合軍。燕推牛角為帥，俱攻癭陶（今河北寧晉西南）。牛角為飛矢所中。被創且死，令眾奉燕，告曰：“必以燕為帥。”
張燕： 常山真定人，本姓褚。黃巾起，合聚少年為盜，眾萬餘人。與張牛角合軍。牛角死，眾奉燕，故改姓張。燕剽捍捷速過人，故軍中號曰飛燕。其後人眾寢廣，常山、趙郡、中山、上黨、河內諸山谷皆相通，其小帥孫輕、王當等，各以部眾從燕，眾至百萬，號曰黑山。靈帝不能徵，河北諸郡被其害。燕遣人至京都乞降，拜燕平難中郎將。袁紹與公孫瓚爭冀州，燕遣將杜長等助瓚，與紹戰，為紹所敗，人眾稍散，太祖將定冀州，燕遣使求佐王師，拜平北將軍；率眾詣鄴，封安國亭侯，邑五百戶。
楊鳳： 黑山軍將領。漢靈帝遣使拜楊鳳為黑山校尉，領諸山賊，得舉孝廉計吏。
於毒： 黑山軍將領，隨張燕破鄴城，殺太守慄成。後袁紹引軍入朝歌鹿場山蒼巖谷討於毒，圍攻五日，破之，斬毒及長安所署冀州牧壺壽。（袁紹後遂尋山北行，擊左髭丈八等，斬之。又擊劉石、青牛角、黃龍、左校、郭大賢、李大目、於氐根等，皆屠其屯壁，奔走得脫，斬首數萬。）
白繞： 黑山軍將領。獻帝初平二年（191）；曹操出兵鎮壓黑白繞部，佔據濮陽（今河南濮陽西南）。
眭固： 黑山軍將領。《演義》中為河內太守張楊屬下。固在張楊被楊醜釘死後，殺掉楊醜投靠袁紹，後在與曹軍作戰中陣亡。
陶升： 黑山軍將領。193年（初平四年）三月，冀州魏郡袁紹軍兵變，交合黑山軍佔據鄴城。陶升叛變，保護袁紹與州史家屬到斥丘，紹任其為建義中郎將。
郭太： 又名郭大，白波軍首領，中平五年二月（185年）於白波谷（今山西襄汾永固鎮）復起，號為“白波黃巾”，有眾十餘萬，攻太原、入河東郡，擊敗董大將牛輔。又聯合內遷於汾河流域的南匈奴於夫羅，連破太原、河內等郡，威脅洛陽，成為可恥的漢奸。
李樂、韓暹：白波軍將領。奉詔與董承、楊奉等護衛獻帝至洛陽。後畏懼曹操的威勢，聯合楊奉對曹，後被關羽、張飛殺死（演義版）。
馬相、趙祗 自號黃巾，中平五年起事於綿竹（今四川綿竹東南），連破益州（今四川廣漢北）、犍為（今四川彭山東）、巴郡（今四川重慶北嘉陵江北岸）等，控制益州大部。
何儀：汝南、潁川處的黃巾軍將領，聚眾數萬，先是響應袁術，後又依附孫堅，最終被曹操擊敗，率眾投降。《演義》為自守的許褚所擒。後褚歸順曹操，獻出何儀，被斬。
管亥： 青州軍將領。圍困海太守孔融于都昌。太史慈突圍去平原相劉備求救。備派兵三千隨太史慈前去解圍，黃巾軍解圍散走。《演義》中亥與關羽交戰數十合被殺。
劉闢、龔都：汝南黃巾將領。後追隨劉備。《演義》中闢為高覽所殺，龔都被夏侯淵殺掉。
杜遠： 《三國演義》中虛構黃巾餘部，與廖化在許昌附近落草，關公千里走單騎第一倒黴就是被杜遠劫了兩個嫂子，欲與廖弟弟共產共妻，被廖化殺死。
廖化： 字元儉，本名淳，襄陽人。正史中為前將軍關羽主簿，羽敗，屬吳。思歸先主，詐死，攜持老母晝夜西行。劉備以化為宜都太守。扣為丞相參軍，後為督廣武，稍遷右車騎將