在成功保護“宇宙之心”後，聯合艦隊開始對其進行深入研究。然而，這個過程充滿了艱難險阻。
“宇宙之心”蘊含著極其強大且不穩定的能量，稍有不慎就可能引發無法控制的災難。聯合艦隊的科學家們日夜奮戰，嘗試各種方法來解析其能量結構和執行機制。
就在研究稍有進展之時，聯合艦隊收到了來自多個星系的緊急求救訊號。一種神秘的病毒在宇宙中迅速傳播，感染了無數的星球和生命。這種病毒具有極強的傳染性和致命性，能夠在短時間內摧毀整個文明。
聯合艦隊立刻兵分多路，前往受災星系展開救援。他們發現，這種病毒不僅能夠侵蝕生物體，還能影響機械和能量系統，使得艦隊的裝備也面臨著被感染的風險。
為了應對病毒的威脅，聯合艦隊再次對裝備進行升級。他們研發出了一種“能量淨化護盾”，能夠過濾和消除周圍的病毒粒子。同時，利用生物能量文明的技術，培育出了能夠吞噬病毒的特殊生物製劑，透過空投的方式投放到受災星球上。
在救援行動中，聯合艦隊遭遇了重重困難。一些受災星球的居民對他們充滿了恐懼和誤解，拒絕配合救援工作。還有一些勢力企圖利用這場災難謀取私利，暗中破壞聯合艦隊的行動。
但是，聯合艦隊的戰士們始終沒有放棄。他們耐心地與居民溝通，展示自己的善意和決心。同時，與那些破壞勢力展開堅決的鬥爭，維護救援行動的順利進行。
經過漫長而艱苦的努力，聯合艦隊終於成功控制了病毒的傳播，拯救了無數的生命和文明。他們的英勇事蹟在宇宙中傳頌，贏得了廣泛的讚譽和尊重。
然而，聯合艦隊還沒來得及喘口氣，新的危機又接踵而至。
一個名為“虛空霸主”的強大勢力出現了。他們來自宇宙的虛空深處，擁有著能夠操控虛空能量的恐怖能力。虛空霸主企圖征服整個宇宙，建立自己的絕對統治。
聯合艦隊與虛空霸主在多個戰場上展開了激烈的交鋒。虛空霸主的軍隊能夠在虛空中自由穿梭，出其不意地對聯合艦隊發動攻擊。他們的武器能夠釋放出強大的虛空能量，對聯合艦隊的戰艦造成巨大的破壞。
為了對抗虛空霸主，聯合艦隊不斷升級自己的火力和裝備。他們研發出了“虛空抑制器”，能夠干擾虛空能量的流動，限制虛空霸主的行動。同時，對艦隊的戰術進行了創新，利用星際矩陣防禦系統構建出強大的防禦網路，抵禦虛空霸主的攻擊。
在一場決定性的戰役中，聯合艦隊與虛空霸主展開了最後的決戰。戰場上，虛空能量與聯合艦隊的各種武器光芒交織在一起，形成了一幅壯觀而又慘烈的畫面。
聯合艦隊的戰士們捨生忘死，奮勇作戰。主角帶領著一支精銳小隊，深入虛空霸主的旗艦，與敵人展開了殊死搏鬥。
經過一場驚心動魄的戰鬥，聯合艦隊終於擊敗了虛空霸主，保衛了宇宙的和平與安寧。
但戰爭的創傷需要時間來撫平，聯合艦隊開始投入到戰後的重建工作中。他們幫助受災的星系恢復生態，重建文明，同時加強了宇宙的防禦體系，以防備未來可能出現的威脅。
在一次對偏遠星系的探索中，聯合艦隊發現了一個神秘的遺蹟。這個遺蹟中似乎隱藏著一種超越現有科技的超級技術。
聯合艦隊的科學家們興奮不已，他們立刻展開研究。然而，在研究過程中，他們發現這個超級技術的背後隱藏著一個巨大的危險。
這種技術需要消耗大量的能量，並且如果控制不當，可能會引發宇宙級別的災難。聯合艦隊陷入了兩難的境地，是放棄研究以避免潛在的危險，還是繼續探索以獲取可能改變宇宙格局的力量。
經過激烈的討論，聯合艦隊決定在確保安全的前