在科技倫理領域，隨著意識上傳與數字化永生技術的研究逐步推進，相關的倫理爭議也日益凸顯。儘管聯盟的科技倫理研究小組提前制定了一些指導原則，但實際操作中仍面臨諸多複雜問題。例如，意識上傳過程中如何確保意識的完整性和連續性，以及數字化後的“生命”如何融入現有的社會體系等問題引發了廣泛討論。不同文明對於這些問題的看法存在較大差異，部分文明認為意識上傳違背了自然的生命規律，可能會導致一系列不可預測的社會問題；而另一些文明則認為這是科技發展的必然趨勢，能夠為生命的延續和發展帶來新的機遇。這種觀念上的分歧給科技倫理規範的統一實施帶來了困難，需要聯盟進一步協調各文明之間的立場，尋求共識。
軍事防禦方面，雖然在新型軍事技術研發上取得了一定進展，如基於暗物質的隱形裝甲概念已初步形成理論框架，但在實際應用中面臨著巨大的技術障礙。暗物質的特性極為特殊，難以捕捉和操控，要將其轉化為實用的隱形裝甲材料，需要克服一系列複雜的技術難題。此外，隨著對宇宙中潛在威脅的深入研究，聯盟發現一些遙遠星系中似乎存在著高度發達的未知文明，雖然目前尚未與他們有直接接觸，但從一些間接觀測到的跡象來看，這些文明的科技水平可能與聯盟不相上下甚至更先進。這使得聯盟不得不重新評估自身的軍事防禦能力，加強對未知文明可能發起的潛在攻擊的防範。
在跨文明交流與合作領域，儘管在生態保護和災害應對等方面的協作取得了一定成果，但在具體實施過程中也暴露出一些問題。例如，在宇宙生態監測網路的建設中，各文明之間的資料格式和監測標準存在差異，導致資料整合和共享出現困難。在災害應對方面，不同文明的救援裝置和技術標準不統一，影響了救援行動的效率。此外，隨著文化交流的深入，一些文明擔心自身獨特的文化在融合過程中會逐漸被同化，對文化傳承產生了擔憂。
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