經過長達五六個小時的慘烈戰鬥，珍珠港的港口水面上到處漂浮著水兵的屍體和戰艦的殘骸，一片狼藉慘不忍睹。港口裡的水面上已經沒有任何一艘完整的戰艦，曾經那繁忙而強大的太平洋艦隊基地，此刻已化為一片廢墟。而倭國剩下的三艘巡洋艦，卻並未停止攻擊的腳步，它們一發一發地將炮彈精準地打向港口內的船塢。船塢內那些正在修理或新建的軍艦，在炮彈的無情轟炸下被撕成碎片，船塢的設施也被嚴重破壞，海水洶湧灌入，將這裡徹底摧毀。
就在這時，倭國第二波轟炸機又如同蜂群一般飛了過來。它們根據之前偵察人員提供的精確指示，對山上的油庫、彈藥庫、軍營等重要目標展開了猛烈襲擊。機場的飛機，在第一波的進攻中已經損失了大部分，跑道也被炸燬得坑坑窪窪，面目全非。鬼子的戰鬥機見到正在救火的地勤人員和空軍駕駛員，竟喪心病狂地俯衝下去，用機炮進行覆蓋式射擊，許多無辜的生命瞬間消逝。機庫中的飛機也未能倖免，在航空炸彈的暴力摧毀下，幾乎都被倒塌的機庫頂部那沉重的鋼筋混凝土砸爛，成為一堆堆廢鐵。機場上被炸燬的飛機流出的燃油引發了熊熊大火，火勢迅速蔓延，許多飛機在大火中殉爆，爆炸產生的巨大濃煙直衝雲霄，連環爆炸更是此起彼伏。油庫燃起的大火如惡魔般肆虐，軍火庫爆炸產生的衝擊波，如同洶湧的海嘯一般，將周邊幾百米內的建築全部夷為平地。航站樓在這一系列的災難中終於經受不住負重，轟然倒塌下來，整個機場到處一片狼藉，彷彿是世界末日的景象。
看著一波波順利起飛並展開攻擊的轟炸機，雲南海軍司令官一直緊繃著、擔憂的心，此刻終於緩緩放了下來。他如釋重負地長舒一口氣，隨後將戰報發回國內。完成這一切後，他彷彿被抽乾了所有精力，迷迷糊糊地坐在指揮椅子上睡著了。這幾天來，他從未睡過一個好覺，因為他深知此次行動的重要性與危險性。他所率領的可是倭國幾乎全部的海軍力量，這是一場豪賭，一旦有失，倭國海軍將在幾年內都難以翻身。而此刻，從目前的戰況來看，這次突襲已經完全達到了預期目的。米國在遭受如此重創後，一年內將很難阻止倭國的擴張步伐，世界格局也將因此而發生巨大變化。
但任何事情一旦發生，往往就會不以人的意志為轉移。距離港口五公里外山上設定的油庫，儲存著多達 450 萬噸的重油，其保衛措施自然也是極為強大的，有兩個團的高射炮部隊專門負責保衛。在第一輪轟炸中，這裡並未受到波及。但是，當太平洋艦隊司令金上將得知倭國偷襲港口和機場後，第一時間通知油庫高射炮部隊，要求他們加強保衛力度，所有人員必須堅守在第一線。首先要全力做好防空工作，確保油庫不被空襲摧毀；其次要做好撲滅大火的準備，以防萬一遭到轟炸後引發嚴重火災。
當第二批飛機飛抵油庫上空時，港口已經基本上沒有什麼可供轟炸的艦船了。連幾個大型船塢中的巡洋艦和驅逐艦都被炸得面目全非，沉入水底。之前，他們在尋找潛艇的過程中也遇到了極大困難，米國的太平洋艦隊原本擁有二十八艘潛艇，雖然在戰鬥初期炸燬了十幾艘，但仍有漏網之魚。畢竟，擁有近百艘艦船的港口水域廣闊，想要在其中尋找潛艇並非易事。而此刻，轟炸山上的油庫卻陷入了僵局。幾十架飛機試圖對油庫進行有效投擲航空炸彈，但都未能成功，紛紛折戟沉沙，被高射炮部隊擊落。甚至在第一波次攻擊中，只有十幾架轟炸機成功投彈，其餘都被擊落。在戰鬥過程中，不斷有飛機被擊傷後退出戰鬥，又不斷有新的飛機進入防空網，卻被凌空打爆。偶爾有落在油庫的飛機殘骸起火，但也被迅速撲滅，油庫在高射炮部隊的頑強保衛下，暫時還未被攻破，成為了這場慘烈戰鬥中的一個意外變數。
戰鬥逐漸進入到了白熱化的膠著狀態。起初，倭國方面根本沒有