各大部落首領聽後齊齊躬身應是，他們怎麼也想不到平時不顯山不露水的青年會得到聖父的垂青，一舉成為萬人敬仰的人皇
“謝聖父~”名叫神農的青年從愕然中驚醒，隨即壓下驚喜，朝天空中的聖父拜倒。
從此，人族進入神農時代，一個農耕醫藥時代沒有人能夠教導神農，因為神農喜歡醫藥，可滿天神佛都對草藥不感興趣，這些神佛一個法術就能治癒創傷，誰還研究草藥？
無師自通的神農，憑藉水晶肚腩嘗百草，最終寫成‘神農百草經’當神農百草經問世，天降功德於神農，人族第二位皇者，地皇神農功德圓滿，在遮天聖父的主持下，準聖巔峰的地皇神農進入人族聖殿
立黃帝為人族共主後，黃成虎再次離去。
回到蓬萊仙島修煉數年後，黃成虎突然接到巫族求救，出於對后土祖巫的愧疚，黃成虎接見了大巫青雲。見到大巫青雲後，黃成虎才明白巫族面臨的絕境，原來轉世成蚩尤的巫十三帶領殘留下來的巫族企圖和黃帝爭奪天地主角，本來巫族接連大勝，黃帝根本就不是蚩尤和九黎部落的對手可道門太上老子派下師侄廣成子手持軒轅劍相助黃帝，蚩尤大意之下接連被軒轅劍所傷，這時回過味來的蚩尤才意識到聖人開始插手洪荒主角爭奪大戰
大巫青雲講述完畢後，指著天外天大罵：“聖人無道，以萬物為芻狗，居然重新煉製屠巫劍，改名為‘軒轅劍’屠殺我巫族，還請遮天大聖為我巫族做主”
黃成虎嘆息一聲，左右為難道：“巫族是本座的手足，可人族卻是本座的孩子，蚩尤於人族交戰，青雲大巫為何難為遮天？”
大巫青雲臉色羞愧不已，可巫族大難之下，青雲也顧不得面皮厚薄，再次俯首懇求：“還請大聖念在后土祖巫份上，給巫族一條活路。”… 面對大巫青雲的苦苦相逼，黃成虎無奈之下，只能再次踏出蓬萊仙島。
在大巫青雲的引領下，黃成虎來到了不周山巫族發源之地，在祖巫殿見到了一眾大巫，可惜沒有見到轉世重生的巫十三，即蚩尤
“首領何在？遮天大聖到了”大巫青雲見到一幫兄弟披麻戴孝，心中那抹不妙感覺越來越強烈。
大巫九鳳迎著兩人走出，先朝遮天行禮，接著朝青雲沉痛道：“蚩尤首領隕落了”
“怎麼可能？”大巫青雲顫聲驚叫，接著大跨步衝入祖巫殿，抬眼看到了蚩尤的靈柩 黃成虎跟著大巫青雲走入祖巫殿，同樣發現了裡面的一切，並且透過時空雙瞳還看到了靈柩中那副無頭屍體，和一柄琥珀兇刀。
殺啊~
人族共主黃帝，在帝師廣成子的輔佐下，率領千萬大軍殺到了巫族發源之地，同時被十萬強大的巫族攔了下來。這十萬巫族自然是黃成虎藏在上三天最後的十萬巫。
十萬大巫並沒有屠戮人族，只是將黃帝的千萬大軍擋在了祖巫殿之外不得寸進。
黃成虎此時矛盾到了極點，一方是他的族人，一方是他女人的族人，現在他才體會到女媧娘娘心中的苦楚。
見到黃成虎左右為難，大巫青雲提議：“我等還是暫且退入盤古聖殿”
“不可那裡是我等出生的地方，還是盤古父神的頭顱化成，是我巫族最後的聖地，就連祖巫們都不能隨便進，我等更不能進”刑天扯著嗓門反對。
大巫青雲白了刑天一眼，喝問道：“刑天，你能抗住軒轅劍的鋒銳？”
刑天臉色百變，最終屈服下去。在場眾巫一致同意，暫避鋒芒，退入盤古聖殿黃成虎無力地附議，跟著進入到了盤古聖殿。 對於盤古聖殿，黃成虎也很好奇，他早就聽說盤古聖殿，乃是巫族之源，乃是開天大神盤古頭顱所化。即使心中有了準備，黃成虎還是被盤古聖殿的恢弘震撼了心神。所謂盤古聖殿好比前世一個城市般巨