在古老存在的協助下，宇宙的修復工作進展順利。林羽、靈兒和戰士們在各個星系間奔波，見證著生命與文明的復甦。
然而，新的問題悄然浮現。宇宙在經歷了這場巨大危機後，原本相互隔絕的一些神秘空間開始與主宇宙融合。這些神秘空間中蘊含著未知的能量和奇特的物質，它們的出現給宇宙帶來了新的變數。
林羽和靈兒帶領團隊前往一個正在與主宇宙融合的神秘空間進行調查。剛一接近，飛船的儀器就開始出現異常，各種資料瘋狂跳動。他們小心翼翼地進入其中，發現這裡的物理規則與主宇宙大相徑庭。
這裡的光線是扭曲的，時間的流逝也變得難以捉摸。一些類似水晶的物體在空中漂浮，它們內部似乎有生命在流動。突然，這些水晶物體發動了攻擊，它們釋放出的能量射線能改變周圍空間的性質，使得林羽等人難以躲避。
靈兒嘗試用心靈之力與這些水晶物體溝通，卻發現它們的思維模式完全超出了理解範圍。林羽則努力調整飛船的能量防護，以應對不斷變化的攻擊。戰士們在混亂中尋找反擊的機會，他們使用特殊的能量武器，試圖打破水晶物體的攻擊節奏。
在激烈的戰鬥中，他們逐漸發現這些水晶物體的攻擊是圍繞著空間中的某些節點展開的。林羽推測，這些節點可能是控制這個神秘空間與主宇宙融合的關鍵。如果能控制這些節點，或許可以阻止可能出現的新危機。
於是，他們兵分兩路。林羽和一部分戰士負責吸引水晶物體的注意力，靈兒則帶領其餘戰士朝著節點的方向前進。在接近節點的過程中，靈兒遭遇了新的阻礙，一些由能量和物質混合而成的迷霧阻擋了他們的去路，迷霧中隱藏著強大的能量波動，稍有不慎就會被吞噬。
靈兒集中精神，利用心靈之力探尋迷霧中的安全通道。在她的帶領下，戰士們艱難地穿越迷霧，終於到達了節點所在的區域。這裡的能量更加狂暴，節點像是宇宙風暴的中心，閃耀著耀眼的光芒。
靈兒和戰士們開始嘗試控制節點，他們運用所學的能量知識和技術，與節點的能量進行對抗。而林羽那邊，在長時間的戰鬥後，也逐漸找到了水晶物體的弱點，開始對它們進行反擊。
整個神秘空間都陷入了激烈的能量碰撞之中，林羽和靈兒能否成功控制節點、阻止新危機，宇宙的命運再次懸於一線。林羽這邊成功找到了水晶物體的弱點，他操控能量核心釋放出一種特殊頻率的脈衝波，這種脈衝波能干擾水晶物體的能量結構。在脈衝波的攻擊下，水晶物體的攻擊開始變得無序，戰士們抓住機會，一舉摧毀了大部分水晶物體。
而靈兒那邊，他們在節點周圍構建起一個臨時的能量護盾，以抵禦狂暴的能量衝擊。靈兒將自己的心靈之力與節點相連，試圖感知節點的執行機制。她發現這些節點就像是一把把鑰匙，正在開啟神秘空間與主宇宙融合的大門，如果不及時阻止，主宇宙的能量平衡將被徹底打破。
於是，靈兒指揮戰士們將飛船上的能量模組取出，試圖修改節點的能量頻率，讓它們停止融合程序。然而，節點的能量太過強大，每一次嘗試都像是蚍蜉撼樹，戰士們的能量模組在接觸節點的瞬間就被摧毀。
就在他們陷入困境時，林羽帶著剩餘的戰士趕來。他觀察了一下節點的情況，想到了一個辦法。他將能量核心的力量分散到每個戰士身上，然後讓戰士們同時將能量注入節點。在強大的能量衝擊下，節點開始出現不穩定的跡象。
靈兒見狀，再次施展心靈之力，引導節點的能量朝著有利於他們的方向變化。經過一番艱苦的努力，節點的能量頻率終於被改變，神秘空間與主宇宙的融合程序停止了。
但此時，他們發現其他正在融合的神秘空間也受到了這個節點變化的影響，融合速度