準常在真宗面前詆毀他，他卻一致稱讚寇準。真宗對他說：&ldo;你盡講他好，他卻專講你壞。&rdo;他說：&ldo;我久在相位，政事缺失必多。寇準直言無隱，更見其忠直，我也因此推重他。&rdo;
寇準在樞密院，見中書公事有違條例，便奏報真宗，王旦被責，中書堂吏都受罰。不久樞密院有公事送中書，也有違例處，堂吏送呈王旦，指望他報復，王旦卻指示送還樞密院。寇準見到王旦慚愧的說：&ldo;同年，你怎麼這麼大肚量？&rdo;寇準罷樞密使時，託人向這位同科進士求使相，王旦斷然拒絕道：&ldo;將相之任，豈可私求！&rdo;
翰林學士陳彭年上書中書，王旦看都不看，封存留檔，向敏中勸他瀏覽一下，他說：&ldo;不過是興作符瑞希圖仕進罷了。&rdo;真宗早就欲相王欽若，他援引太祖太宗朝的慣例說：&ldo;祖宗朝未嘗有南人當國的。我為宰相，不敢抑人，這也是公議。&rdo;真宗終於不敢固執己見。
天禧元年（1017年）正月，王旦以身體欠佳，上表辭相。真宗允許他五日一赴中書，遇軍國重事，不論時日入預參決，對他表示極大的信任。但王旦對沒能阻止天書鬧劇，內心深懷著一種說不出的愧疚。每次天書封祀的大典，王旦都必須陪同隨行，史書說他總是&ldo;悒悒不樂&rdo;，對他說來是一種痛苦不堪的事情。真宗每次送來賞賜的物品，他總是閉眼嘆氣道：&ldo;生民膏血，哪裡受用得這麼多！&rdo;
七月，王旦終於獲準辭去相位，臨別，真宗問他誰可代其為相，他強起舉笏道：&ldo;莫如寇準。&rdo;真宗嫌寇準性格剛褊，讓他再舉其次，他說：&ldo;他人，臣所不知。&rdo;九月，真宗在王旦死前親臨其家探病，賜白金五千兩。王旦在遺表結尾加上四句：&ldo;益懼多藏，況無所用，見欲散施，以息咎殃。&rdo;隨即命家人把白金送還。
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