配給他們不同的角色，就象電腦遊戲中的角色扮演遊戲一樣，只是他們沒有選擇角色的權利和意識。人類透過這種聯網的虛擬生活來維持自身的生存需要，但Matrix中的智慧程式，也就是先知的角色，發現在系統中有1％的人由於自主意識過強，不能相容系統分配的角色，如果對他們不進行控制就會導致系統的不穩定，進而導致系統崩潰。因此編寫Matrix的智慧程式，也就是建築師就製造了“救世主”，讓他有部分自主意識，併成為覺醒人類的領袖，帶領他們建造了錫安。
“整個Matrix就是一套嚴禁的系統，但根據奧地利數學家哥德爾在1931年發表了題為《論數學原理及有關係統的形式不可判定命題》的論文，其中提出這樣一個觀點，在任何數學系統中，只要其能包含整數的算術，這個系統的相容性就不可能透過幾個基礎學派所採用的邏輯原理建立。簡單地說，就是在任何系統中，總有些真理是遊離於邏輯之外的，這些真理就叫做歌德爾命題。”
“那麼所謂的救世主，就是指遊離在Matrix之外的存在？”
在Matrix中，尼奧就是在Matrix這個嚴整系統中不能被數學推得的歌德爾命題，不符合系統的規律。（建築師對尼奧的談話中涉及部分）當尼奧重生後，他就擔負起系統所有的擾動，所有的規則在他面前都變得透明，因此他能夠看到系統中別人所看不到的東西。
先知叫尼奧回到源頭去終止災難，在數學邏輯中就是將歌德爾命題變成整個系統的一部分，當作系統的一個變數，從而消除整個系統的不確定性。如果尼奧當初選擇了毀滅錫安的門，他所攜帶的程式碼將反饋給系統，將系統的穩定性提高到一個新階段。而這個選擇的前提則是系統中沒有斯密斯這個狂人。但從數學的角度上來說，這樣的穩定也是暫時的，不是對系統的徹底修正，新的系統還是會產生自己的歌德爾命題，從而繼續這個輪迴。這就是為什麼在尼奧之前會有六任救世主的原因。
按照建築師最初編寫救世主時的任務，救世主的使命就是在錫安執行一段時間後，將錫安的程式碼帶回到Matrix的源程式進行重灌，同時機器摧毀錫安，完成Matrix系統的升級。之後救世主將按照初始設定，帶領16女7男返回真實世界，再開始重建錫安，等待下一代的救世主。
而尼奧與前任們不同的是，建築師在他的意識中編寫了關於愛的編碼，這本來是系統處於不斷升級的需要，也是考察人類反應的新實驗。但這個關於愛的編碼，不但導致了尼奧在第二集中做出違背程式設定的選擇，而且在第三集中將“愛情”昇華為“博愛”，從而最後終結了戰爭，終止了矩陣和錫安之間的迴圈。
“那麼你現在明白了嗎？”蒼井沒好氣地說，不過，她突然呆住了，而御手洗卻還在消化這些訊息，沒有注意到蒼井神情的改變。
“嗯，我現在要做的，不是在虛擬世界中亂逛，而是去融入這套電影中，取代被殺死了的尼奧，是不是這樣。。。。。。蒼井？蒼井？”御手洗終於發現了蒼井的問題，他用手在蒼井的面前不斷左右晃動。
“我明白了，我明白了！”蒼井突然跳了起來，抓著御手洗的手大叫。
“你明白什麼了？！”御手洗甩開蒼井的手。
“我終於明白龍崎為什麼要選你做救世主了，記得上次在《終結者》中先知和你說過的話嗎？”蒼井興奮地說。
“記得，她那時糊里糊塗地對我說，年輕人，你很有潛力，我很看好。。。你的意思是，從那時候起，她就已經選定了我？！”御手洗終於反映了過來。
“對啊，從那時起，其實你就已經被賦予了TheOne的身份，只是先知那句話實在是太模糊了，反而讓我忽略了，哇哈哈，我有辦法打敗