五千川軍趕赴朝鮮，被任命為副總兵。
日軍大部分主力向南退卻至釜山一帶，兩週之後，明軍主力推進至慶州。日軍自上年登陸釜山入侵朝鮮，至此全軍減員四萬餘眾。
明朝“徵倭大軍”在入朝作戰數月之內，攻城掠地，橫掃千里，除全羅道和慶尚道等沿海地區為日軍所佔外，成功收復朝鮮大半國土。
此後陸戰主要集中於朝鮮南部地區進行，戰鬥雙方以朝鮮勤王軍與日軍為主。6月中旬，日軍攻打南部從城鎮晉州，加藤清正、黑田長政分別派出本軍悍將，以龜甲車攻毀城牆之薄弱部分，開啟缺口之後，日軍蜂擁攻入城內，朝鮮守將自殺殉國，晉州再次淪陷。 電子書 分享網站
六 日軍陷入全線被動（3）
與陸軍的作戰不利相反，朝鮮水軍卻是連連獲勝。
由於日本軍團後勤給養髮生嚴重困難，在朝日軍統帥宇喜多秀家多次向名護屋發出告急信。九鬼嘉隆又率領三支艦隊同時增援日軍。
7月7日，李舜臣得到日本艦隊停靠在見乃梁的情報，但因該海域過窄，朝鮮板屋船很難調動方向，加上日艦一旦勢弱，很有可能逃竄，李舜臣最終決定將日艦引至開闊水域予以殲滅。
第二天，李舜臣率幾艘船隻前去誘敵，其他艦隊在閒山島海域設伏。朝鮮小股艦隊誘敵成功後，撤退到達預定地點後，與朝鮮主力艦隊匯合。李舜臣登臨旗艦，展開鶴翼陣形攻擊敵艦，把日本艦隊成功包圍，並率先攻打日軍旗艦，大部分的日本戰船還沒來得及接近朝鮮艦隊，就被火炮擊沉海底，在這場戰役中，朝鮮以五十四艘艦隻對戰日艦七十三艘，結果日方共損失五十九艘，朝鮮艦隊則毫無半點損失。
閒山島海戰被世界著名海洋歷史學家馬漢寫入《海權論》，併成為名震世界的著名海戰案例。
閒山島海戰之後，李舜臣率領新編水軍在南部海域展開還擊，使得豐臣秀吉“水陸並進”全面落空，日軍輸送後續兵力和糧食輜重至朝鮮半島的企圖被有力遏制。
李舜臣的龜船艦隊一個多月的時間先在玉埔海面擊沉擊傷了日本水軍戰船近五十艘，朝鮮水軍僅僅一人輕傷；隨後又轉戰露梁海面連破日軍龜井茲矩的補給艦隊，擊斃龜井茲矩，並將九鬼嘉隆水軍的主力艦隊完全摧毀。
自從日軍登陸之後，朝鮮水軍就在全羅道左水使李舜臣的率領下展開一連串反擊，在明軍馳援朝鮮的同時，朝鮮水師在海面上已獲得大半制海權。
明軍援朝部隊雖然收復了朝鮮大半國土，但是本軍也付出巨大代價，明朝國內也是不堪重負。特別是碧蹄館一戰，雖然明軍有力地粉碎了日軍的北進意圖，但也使得明軍看到了日軍的強大戰鬥力。
朝鮮政府當然不願意看到明軍推進發生遲疑，在朝鮮大臣王德完給國王的上疏中抱怨道：“（碧蹄館戰後，明軍）魄散膽破，乃悚心堅意，惟封貢是圖，不復言戰鬥事矣。”
明軍是否真的是“魄散膽破”了？朝鮮大臣說了不算，他們一心想的是請“上國天兵”火速收復失地，但是兵餉糧草、損兵折將這樣的戰爭代價卻要“上國”自己全部擔負，箇中難處，朝鮮大臣不可能有切膚之感，他們的切膚之痛是淪喪國土於“倭賊”，其復仇心理應該理解，但明朝方面也有自己的現實困厄。
明朝兵科右給事中侯慶遠也給萬曆皇帝上疏道：“我與倭何仇，為屬國勤數道之師，力爭平壤，以權收王京，挈兩都授之，存亡興滅，義聲赫海外矣。全師而歸，所獲實多。”在明朝內部，也有部分官員認為明朝作為宗主國，徵國內數道之師，勞民傷財，遠赴屬國，如今已經幫助朝鮮人民收復了平壤、王京等戰略要地，可以說已經仁至義盡，剩下的事情就需要朝鮮自己去完成了。
但在朝明軍將領卻表達了不同意見