己得償夙願而有些沾沾自喜。
而德國人則在10月，派遣兩艘裝甲巡洋艦護送第一批3個師的陸軍前往菲律賓，開始正式接收菲律賓後的恢復社會安定行動。
就在這個時候剛剛改組完成不久的帝國海軍辦公室就準備在即將到來的1899年初搞出一個大動作。
雖然約亨與1895年末就提出海軍行政系統的大改革，不過實際工作卻是從1897年才開始的，期間也受到了相當大的阻力。
首先是來自帝國總參謀部的反對，海軍軍事內閣從行政體系上位於海軍總參謀部之下，這意味著海軍總參謀長有權管理海軍軍官的任命。這種權利是陸軍總參謀部所沒有的，要不讓當年瓦爾德澤也不用和帝**事內閣長官馮？阿爾貝迪爾建立密切關係了。海軍擁有陸軍都不曾擁有的權力，這點讓容克軍官團極為抵制。
其次是來自議會的反對，整個海軍總參謀部對皇帝直接負責，那麼這是至首相於何地？從法律上德國可只有一個直接對皇帝負責的官員，那就是首相。陸軍總參謀長就算有直接面見皇帝的權力，但也不是說可以把首相拋到一邊去的，因此議會將這項改革看作是對帝國憲法和對首相權威的冒犯。
受到各方阻撓後。約亨意識到自己有些操之過急想當然了，雖然有皇帝的支援，卡普里維本身也沒有反對。不過就算強行推行下去難免會和陸軍和議會產生裂痕。德國內部的舊勢力就算是皇帝和首相也要掂量掂量要不要對著幹啊。
於是計劃被重新調整，為了安撫陸軍。將帝**事內閣降級，併入帝國總參謀部，帝國總參謀長因此有了對陸軍軍官的任命的管理權。
不過如此一來陸軍的權力就會大增，那麼約亨提出，建立帝國戰爭部壓到帝國總參謀部頭上去。原本普魯士王**事機構中是有個普魯士戰爭部的，不過現在已經沒了。
普魯士戰爭部實際上就相當於普魯士國防部，管理軍隊的行政事務，不過在有了海軍部以後。戰爭部實際上就相當於陸軍部了。不過因為普魯士總參謀部的權利越來越大，普魯士戰爭部的意義就越來越低了。
自從1870年以後普魯士戰爭部就一直被總參謀部所把持，實際上名存實亡。在組建國防軍時普魯士總參謀部變成帝國總參謀部後，普魯士戰爭部就沒有意義了，然後被腓特烈三世取消。
而現在德**事行政體系分成帝國總參謀部和海軍部這兩個互不統屬的部門。約亨提出，既然如此，不如組建帝國戰爭部，將帝國總參謀部降格為陸軍總參謀部，和海軍總參謀部一起被帝國戰爭部管轄。
並且參照海軍，將軍需總監從總參謀部中分離出來。學習海軍那樣組建獨立的陸軍辦公室，而原本的總參謀部的職能變成了陸軍總司令部的職能。各軍種軍事內閣這個名稱被取消，改為各軍種人事部。
各軍種負責自己內部的人事任命。裝備採購，後勤等任務，但是行政體系上是隸屬於戰爭部之下的，各軍種編制規劃等一些工作需要透過戰爭部長批准，不過戰爭部長沒有作戰指揮權，只能對帝國的國防政策進行規劃。
戰爭部長由文職擔任，作為首相內閣的國防政策顧問。這樣一來打壓了陸軍總參謀部的權利，將海軍提升至和陸軍相同的地位，加強了首相的權威。也符合議會的要求。
當然，德**隊內部的舊勢力對於這種削權行為肯定是牴觸的。因此保留了軍種的作戰指揮權、人事獨立、裝備採購獨立，最