五帝本紀》記載的是遠古傳說中相繼為帝的五個部落首領——黃帝、顓頊（ｚｈｕāｎ ｘū，專須）、帝嚳（ｋù，酷）、堯、舜的事蹟，同時也記錄了當時部落之間頻繁的戰爭，部落聯盟首領實行禪讓，遠古初民戰猛獸、治洪水、開良田、種嘉穀、觀測天文、推算曆法、譜制音樂舞蹈等多方面的情況。這些雖為傳說，但從人類歷史發展的規律和地下文物的發掘來看，有些記載亦屬言之有徵，它為我們瞭解和研究遠古社會，提供了某些線索或資訊。中華民族五千年的悠久歷史，就是從這遠古的傳說開始的，黃帝和炎帝兩個部落的聯合，戰爭，最後融為一體，在黃河流域定居繁衍，從而構成了華夏族的主幹，創造了我國遠古時代的燦爛文化。
司馬遷寫作《五帝本紀》主要取材於《世本》《大戴禮記·五帝德》和《尚書》。材料安排巧妙是本篇的突出特點，如黃帝與蚩尤的涿鹿之戰、與炎帝的阪泉之戰，並非不可以重筆描繪，但都只是平平帶過，而把筆力集中到堯、舜二帝身上去。這或許有材料不足的原因，但其效果是既突出了由黃帝開創，由堯、舜繼承併發揚光大的帝王事業，又使歷史事件與全篇的結構極其和諧。在敘寫方式上，本篇開頭對黃帝、顓頊、帝嚳的記述，都是用敘述的口吻，侃侃道來；到了本篇的中心部分，則又利用了敘議結合，敘事中穿插對話的方式，既突出了堯、舜知人善任、從諫如流的部落聯盟首領的政治家風貌，也烘托出為歷代儒家所日夜思慕的自由、民主、君臣和睦的祥和政治氣氛。
五帝開創的事業是中華民族幾千年文明史的開端，《五帝本紀》又是十二篇本紀的首篇。這篇本紀，在記事上確立了歷史發展的根基，在寫作上又為以後各篇的鋪展設下了伏筆。司馬遷利用了連環鎖的敘寫方式，一環緊扣一環。如在寫堯時提出舜，而重在寫堯的知人善任；寫舜時一方面繼續扣緊對堯的敘寫，一方面又突出了對舜的刻畫，同時還帶出了禹、契、后稷等，為以後各篇打下了基礎。
五帝的傳說，幾千年來深深紮根於中華民族的心裡，被當作賢君聖主的楷模歷代傳頌。“炎黃子孫”早已成為凝聚中華民族的親切稱呼，“人皆可以為堯舜”、“六億神州盡舜堯”，也早已成為鼓勵人們賢能為善的有力口號。
黃帝，是少典部族的子孫，姓公孫名叫軒轅。他一生下來，就很有靈性，出生不久就會說話，幼年時聰明機敏，長大後誠實勤奮，成年以後見聞廣博，對事物看得清楚。
軒轅時代，神農氏的後代已經衰敗，各諸侯互相攻戰，殘害百姓，而神農氏沒有力量征討他們。於是軒轅就習兵練武，去征討那些不來朝貢的諸侯，各諸侯這才都來歸從。而蚩尤在各諸侯中最為兇暴，沒有人能去征討他。炎帝想進攻欺壓諸侯，諸侯都來歸從軒轅。於是軒轅修行德業，整頓軍旅，研究四時節氣變化，種植五穀，安撫民眾，丈量四方的土地，訓練熊、羆、貔（ｐí，皮）、貅（ｘｉū，休）、�（ｃｈū，初）、虎等猛獸，跟炎帝在阪泉的郊野交戰，先後打了幾仗，才征服炎帝，如願得勝。蚩尤發動叛亂，不聽從黃帝之命。於是黃帝徵調諸侯的軍隊，在涿鹿郊野與蚩尤作戰，終於擒獲並殺死了他。這樣，諸侯都尊奉軒轅做天子，取代了神農氏，這就是黃帝。天下有不歸順的，黃帝就前去征討，平定一個地方之後就離去，一路上劈山開道，從來沒有在哪兒安寧地居住過。
黃帝往東到過東海，登上了丸山和泰山。往西到過空桐，登上了雞頭山。往南到過長江，登上了熊山、湘山。往北驅逐了葷粥（ｘūｎ ｙù，薰玉）部族，來到釜山與諸侯合驗了符契，就在逐鹿山的山腳下建起了都邑。黃帝四處遷徙，沒有固定的住處，帶兵走到哪裡，就在哪裡設定軍營以自衛。黃帝所封官職都用雲來命名，軍隊號稱雲師。他設定了左右大監，由他們督察各諸侯國。