麼外邊也不知道，可謂佔盡天時地利。就這麼留下來，也沒引起外人懷疑，都認為他們是一時捨不得走。女神雅典娜只關注自己的“新雅典”，也沒興趣注意這夥人的動向。
巴洛斯發展很快，也制定了下一步的行動方向。繼續向更遠的地方前進，建立真正的根據地。巴洛斯只是作為一個前哨站。巴洛斯人制造了新的太空飛船，用一種被稱作“蛙跳”的方法，尋找合適的足夠遠的新領地。這種方法是這樣的：探測飛船一直前進，當燃料不足時，停在某顆行星上，採集製造燃料，完成後繼續前進。反覆幾次，就可以到達非常遠的地方。巴洛斯人在離巴洛斯都很遠的地方，找到了一個宜居星球，取名為“美雅琪”。以此為基地，不斷向更遠更廣闊的星域推進。最後建立了一個新的星際組織，取名叫“自由同盟”。
自由同盟為了促進人口增長，才用了非常手段。採用工業化的手段，在工廠中“生產”人。用高科技手段，改造普通幹細胞變成具有分化能力的胚胎細胞，在模擬子宮的容器裝置中，培養下一代。為了使下一代產生遺傳差別，對每個胚胎細胞的基因進行了差別更改。直接複製人，畢竟成本太高了，因為那純粹是大量原子、分子的複雜堆砌，所以沒有采用。為了更快發展，科學家甚至透過改變基因，大幅縮短了人的生長期。人生長至成年的時間被縮短為5年，各種知識記憶都用機器直接植入大腦。人可以說完全是在用違法的方式生產。
在這裡也沒有星際聯邦的種種科研限令。超光速、人造神、空間跳躍等等的研究都是合法的。經過千年的發展，自由同盟建造了一批兼具超光速和空間跳躍的戰艦，同時也基本實現了EVA計劃，改造出一大批“神”，包括萊因哈特本人也實行了這樣的改造。但畢竟對真正神的能力，也不太瞭解，出於謹慎的目的，沒有對聯邦用兵。為了保持秘密，不讓聯邦懷疑，巴洛斯也一直存在和發展，做足表面文章。
25年前機遇好像來了，由於其他5個文明進入了太空時代，與星際聯邦的領土矛盾顯現。聯邦各個星球都出現了抗議聲，要求本方的神使用強硬手段干涉。波塞東自然不肯。聯邦民眾中關於發展新式戰艦和開展EVA計劃的討論轟轟烈烈，想著既然自己的神不肯幫忙，只能使自己變強，去解決問題。波塞東嚴厲控制，使得自身的威信受到一定程度損傷。
萊因哈特決定先試下水，高調向全聯邦宣佈更改憲法，進行超光速研究，建造新式大威力戰艦，並實施EVA計劃。可是全聯邦都不相信一個邊緣化的星球能搞出什麼名堂來，反響平平，應者寥寥。萊因哈特決定拿出實際性的東西來，震撼一下聯邦民眾，將他們的鬥爭熱情激發出來。為了真實，利用自由同盟的已有技術，在巴洛斯建立研究機構和工廠，折騰出了超光速戰艦“無畏者號”，效能與同盟已有的基本持平。將戰艦的訊息和EVA計劃的初級成果洩露出去，看聯邦的反應。確實新聞效果非常好，但聯邦的反壓也很強大，要求立即拆毀戰艦，取消計劃，不然進行戰爭打擊。執行特別處置任務的艦隊迅速向巴洛斯開進。
萊因哈特決定讓“無畏者號”升空，逃入聯邦內部，將各方面的注意力全部吸引過去。抓緊時間，消除所有自由同盟留在巴洛斯的痕跡。銷燬了超光速戰艦的科技資料。又製造了一批包括自己在內的高階領導人的冒牌複製品頂罪。真身則躲到外太空某個隱蔽的行星，對巴洛斯及自由同盟遠端遙控。
聯邦忙於應付那艘到處流竄的戰艦，忽視了詳盡調查事件的真相。處死了相關罪首，搗毀了超光速造船廠和EVA計劃研究所，又在巴洛斯設定一個監督機構後，就結束了。過了段時間，萊因哈特覺得事情總要有個了結，要搞就搞大的。命令自由同盟作好戰爭準備，將艦隊開赴到聯邦邊境隱蔽。同時還讓所有人造神隨軍。