百鍊成精的程德全明白江蘇乃是衝突的核心地帶，自己這個夾縫人物處在南北之間肯定左右為難，說不定還要遭受池魚之殃，乾脆宣佈辭去江蘇都督之職，北上就任內閣的交通總長。隨後，代理鄂軍都督的段祺瑞也將湖北軍權匆匆交給南下的“幹殿下”段芝貴，返京就任陸軍總長。緊接著，前四川都督蔣志清也乘坐飛機來到京城。
這件事在後世的史書上被稱作“三督入京”，標誌著中央政府加強對地方的控制，清末民初喧鬧一時的各省自治運動已經步入末路。
對於三督入京的原因，一般認為是孫元起與袁世凱在調整軍事部署，準備對南方革命黨採取雷霆一擊。也有人認為這次人事調整的主要操作人是孫元起，其目的是在為即將到來的世界大戰未雨綢繆——眾所周知，孫元起對於國內外形勢的判斷可是首屈一指的，至少從現存史料上看還沒有出現過大的紕漏。還有極少數孫元起的腦殘粉頑固認為，三督之所以願意入京，完全是孫元起的人格魅力所致，歷史已經一再證明，跟著孫元起混才是最有前途的！
其實當初三個人進京都有些心不甘情不願：江蘇、湖北、四川在全國來說都是舉足輕重的大省，可不像雲南、貴州、廣西那種邊邊角角，可以棄之如敝屣！而且執掌全省軍政大權的都督與有名無實的內閣總長相比，可謂一個天上一個地下。但是他們各自都有不得已的苦衷。最終只能乖乖就範。
就拿蔣志清來說，原先四川治下有五千兩三百萬人，規模不亞於東西洋一大強國。加上山河阻隔，完全就是王霸之資。誰知他剛嚐到都督的滋味，就被孫元起調到京中擔任海軍總長。海軍有什麼？十來個人七八條槍。總長完全就是聾子的耳朵——擺設！可他能有什麼辦法？如果再給他一兩年時間，把軍中連排以上的軍官撤換一遍，或許可以藉故推脫孫元起的傳召。但現在不行。
現在四川民眾還時刻銘記孫元起年前蠲免賦稅的好處，軍中骨幹大半是以前從經世大學附屬學校徵召的學生，而且不知道楊度在巴蜀安插了多少釘子。如果他蔣志清膽敢抗命不遵。只怕過不了三五日，就會被擒送到孫元起面前。所以，儘管蔣志清心裡十二萬分不願意。但還是強作歡顏，乖乖地與同樣滿腹牢騷的閻錫山完成交接，然後儘快趕赴京城。並且到京後顧不上休息，便立即去拜訪自己的恩師孫元起。
後世有人曾評價蔣志清的軍事才能頂多只能勝任一個步兵排長。但他玩弄政治陰謀的手段絕對是一等一的。這從他在治川一年多的表現中就可以看出來。見面之後，孫元起對於他的功績也是大加褒讚。
隨著兩人談話步入正途，蔣志清還是忍不住問道：“就學生所知，海軍乃是極具技術含量的兵種，唯有科班出生並在海軍中浸淫多年者才能勝任總長之職，諸如之前的薩鼎銘（薩鎮冰）、劉子英（劉冠雄）皆是如此。學生雖然也是軍校畢業，但所學乃是騎課，畢業後一直在陸軍中歷練。從沒有與海軍打過交道。不知先生為何委任學生為海軍總長？”
孫元起知道蔣志清心裡有怨氣，當下笑道：“確實如介石所言。海軍極具技術含量，普通人還真玩不轉。好在如今咱們海軍的家底已經被折騰得一乾二淨，只剩些三文不值二文的破銅爛鐵，可以由著你們隨意折騰，邊學邊摸索。都說‘外來的和尚會念經’，我很想看看介石你執掌海軍之後，能不能獨闢蹊徑將中國的海軍起死回生？”
蔣志清搖頭道：“先生太抬舉學生了！只是現在中國海軍情況如此，恐怕神仙來了都無計可施！學生在赴京前曾大致瞭解了一下國內外海軍的情況，不瞭解還好，至少心裡還存有一絲希冀；瞭解情況之後，心中完全是萬念俱灰！”
“哦？介石何出此言？”孫元起都是有些好奇。
蔣志清道：“學生僅說兩組資料，先生就知道中國的