（注：曉覆滅篇的時間線在“第66章：封印”之後、“第67章：另一顆寫輪眼”之前）
……
過去，紛爭不斷的戰國時代被千手柱間和宇智波斑一同終結，忍村制度代替了戰國時代的家族制度。
忍者們不再是單純的遊離在國家體制之外的僱傭兵，而是併入了各國之中成為了國家的一員。
這樣的結果雖然成功抑制了戰國時代的混亂不堪，卻也讓小國再也無法撼動大國。
小國只能依附在大國之間，為大國犧牲掉自身的利益。
不過偶爾也會有特例。
雨之國，這個被火之國、風之國和土之國三個大國包圍的小國，曾經在第二次忍者大戰中狠狠地痛擊了大國的忍者。
所屬於雨之國的雨隱村的忍者首領山椒魚半藏強大到連大國都敬畏感嘆。
甚至是年輕的大蛇丸、自來也和綱手也敗在了山椒魚半藏的手中，惜才的半藏饒過了他們一命，並賦予了三人在日後名震忍界的“三忍”名號。
然而英雄遲暮，老年的山椒魚半藏捨棄了年輕時的夢想，雨之國也終究如同其他小國一般，依附著大國尋求著生機。
畏懼著在第二次忍界大戰交惡了大國的忍者們的報復，半藏政權一邊交好大國，積極響應著代表國家友好的聯合中忍考試，一邊對雨隱村進行閉關政策，封鎖了雨之國降低他國的滲透和影響。
然而封閉的政策，並沒有如山椒魚半藏期望的那樣保住他自己的生命，反而讓雨之國避開了五大國的注意，悄然發展出了全新的勢力。
那在雨之國內取代了半藏政權，對外卻依舊維持著半藏政權那虛假存在的勢力，正是覬覦著五大國所擁有的尾獸，以各國叛忍組成的傭兵組織——
——“曉”。
雨隱村，高塔。
在雨隱村的傳說中殺掉了山椒魚半藏的神，佩恩便居住在其中。
神的使徒，有著一頭讓人記憶深刻藍髮的美豔天使，會將眾人對神的祝福帶入高塔之中，讓神知曉。
但在眾人私底下的傳說中，無所不能的神其實並不需要藉由天使去知曉眾人的祝福。
國如其名的雨之國，日復一日的滂沱大雨如瓢潑傾盆。
這對常年都在下雨的雨之國來說是最平常的光景。
但雨隱村的雨，卻是神的恩澤。
神在雨中知曉一切。
而此時此刻，雨隱村這座唯有得到天使的許可才能進入的最高位的神之塔。
居住在其中的神，也知曉了那不請自來了神與天使之外的第三者。
橘色的螺旋麵具從陰暗處出現，面具鑿空的螺旋中心處，是一顆鮮紅的三勾玉寫輪眼。
以黑色為基調的紅色祥雲長袍則在造訪者完全走出陰暗後，才顯眼可見。
他正是自稱為“阿飛”的“曉”組織僅存成員之一。
宇智波……
“斑。”
神低聲呼喊著面具男的名字。
橙黃色短髮的神同樣身著“曉”的制服。
帶領“曉”的存在，居然是神嗎？
然而面對神，宇智波“斑”卻毫無敬意，甚至直呼神的名諱：“看來我回來的正是時候，你已經完成了自己的任務了……佩恩。”
宇智波“斑”面具下的那顆三勾玉寫輪眼，注視著神眼中那雙有著數道螺旋圓圈線條的紫色眼睛。
他繼續開口道：“你成功捕獲六尾算是最近難得的好訊息了。”
“但是現在的情況和我們一開始預計的完全不同！如今仍有一尾、三尾、八尾和九尾四隻尾獸不在‘曉’的掌握中，消失了三年的九尾人柱力再次出現，也在短時間內重創了‘曉