，有此差別罷了。”
傅斯年主持史語所時，曾去北大教課，他附帶的任務就是選拔尖子，充實史語所研究隊伍，時在北大讀書的鄧廣銘先生回憶：“傅斯年、董作賓、李濟、梁思永諸先生都在北大講課，想發現選拔人才。後來，北大畢業生到史學語所去的很多，我的同學中就有胡厚宣、張政烺、傅樂煥、王崇武等人。”
【教育】
1922年，北大教務長蔣夢麟到歐洲考察，與正就讀於倫敦大學的傅斯年作了一次深談。二人分別不久，蔣夢麟在德國接到傅的一封信，信中勸蔣此次考察要特別注意兩個問題：第一是比較各國大學行政制度，第二是各國大學學術的重心和學生的訓練。蔣閱畢，不僅驚歎傅氏在學業上的精湛造詣，同時還發現他有極強的視事與處事能力。
據蔣夢麟回憶：“九·一八事變後，北平正在多事之秋，我的參謀就是適之（胡適）和孟真（傅斯年）兩位。事無大小，都就商於兩位。他們兩位代北大請了好多位國內著名教授。北大在北伐成功以後之復興，他們兩位的功勞，實在太大了。”蔣還稱讚傅為人處事的兩大特徵：“辦事十分細心”和“說一是一，說二是二”的果斷精神。
北京大學、清華大學、南開大學合併為西南聯合大學的建議來源於傅斯年。1936年春，史語所南遷，傅斯年辭去北大兼職，隨所南下。不久，日寇大舉進攻華北。為了保護文教設施，傅斯年提出將北京大學、清華大學和南開大學南遷合組的建議，被國民政府採納。三所大學後遷至昆明組建成著名的西南聯合大學。
傅斯年擔任臺灣大學校長後，做的第一件事就是給每位教師發了一份通知，說本校長說不一定哪天就要聽課，請不要見怪。教師們對聽課不會見怪的，可是傅斯年聽完課之後有的人就沒了工作。當時臺灣工作機會極少，失去教職就得餓肚子。傅斯年僅用此一招，就令臺大的教風學風為之一變。
傅斯年在臺大任校長兩年間，因學術水準低或教學業務不合格而被解聘的教授、副教授很多。他對一般任課教師的選聘也持嚴肅認真態度，有次為了一名助教是否合乎選聘條件的問題，教員聘任資格審查委員會開了四次會，經過幾度激烈的辯論，最後投票表決才決定下來。
傅斯年當臺大校長後，對進行了一番大刀闊斧的改革。凡不合學術水準，濫竽充數的教授，全部驅逐出校門；校內職員，特別是原“帝大”時遺留的醫務人員，凡無醫療常識，不知救死扶傷為何事，只想自己的薪水待遇者，一律解聘。幾個月時間，傅斯年就解聘了70餘名不合格教授與職工。自此，臺大面貌為之一新，形成了一個蓬勃向上的局面。
傅斯年的侄子傅樂成回憶說：“他（傅斯年）經常每日在校辦公6小時以上，一進辦公室，便無一分鐘的休息，有時還須參加校外的集會……他那希望臺大趕快辦好的意念，竟使他坐臥不安。”
在臺大時，傅斯年曾破格聘用殷海光。當時殷海光在《中央日報》被排擠，他直接找傅斯年表示想入臺大。傅斯年考慮他是邏輯學泰斗金嶽霖的得意弟子，臺大又正好缺邏輯教師，所以接受殷海光來臺大教書，但特別說明按規定只能從講師做起，並要求殷以後不許參與任何實際政治，殷海光立即答應。此後在臺大的殷海光雖論政卻不參政，積極宣揚五四的傳統，使得臺大成為自由主義的堡壘。
臺大講師殷海光上課因為評分標準嚴格，期末大批學生邏輯課程不及格，家長跑到傅斯年這告狀，傅斯年高聲重複了殷海光的理由：這是西南聯大的標準！
1950年新生入學考試，國文卷由傅斯年親自命題，其最重要的一題摘自《孟子·滕文公下》中一段：居天下之廣居，立天下之正位，行天下之大道。得志，與民由之；不得志，獨行其道。富貴不能淫，貧