回部高層在帝國政府的自治區政策攻勢下立刻分化瓦解，其中的溫和派很快接受了帝國政府的和平提議，阿依莎沒有想到倪守道口中的帝國皇帝真的肯同意回人治回，雖然自治區政府沒有軍事上的權力，但現在回軍已經被打垮，本來就沒有軍隊，防衛更無從談起了，此時能得到行政權已經是非常不容易的了，加上左宗棠的威脅利誘，雙方終於取得突破，以阿依莎為首的回部自治區政府在左宗棠的大力支援與配合下很快成立，帝國皇帝在批准回部自治區首屆地方政府名單的同時，也正式任命左宗棠為了新疆辦事大臣，統一管理新疆各族事務，並特別給予他調動新疆警察的權力。
除了溫和的一手以外，王財密旨左宗棠相機處理對於朝廷頑抗到底的叛亂分子，而左宗棠對此也是心領神會，秘密派人逮捕了拒絕與朝廷合作的回部強硬派，幾乎是在自治區政府成立的同時，這些強硬分子也在獄中被處決。左宗棠恩威並濟的兩手讓自治區政府從成立的第一天起就不知不覺的處在朝廷的嚴密管理下，只是陶醉在回人治回成功中的阿依莎並沒有意識到而已，事實上就算她意識到了也已經沒有辦法挽回了，因為左宗棠跟她說的很明確，&ldo;如果還想從朝廷那裡得到更多的讓步，只會讓已經到手的東西全部失去&rdo;。
此外王財還給在綏來作戰的倪守道寫了一封親筆信，通篇只有四個字：&ldo;敢作敢為！&rdo;
第二卷 第一百九十八章 ：亞東慘案
回部自治區的成立雖然一路坎坷，但畢竟讓帝國政府找到了一條解決邊疆問題的新辦法，同時王財還接受左宗棠的建議，在回部自治區之下又增設了柯爾克孜、錫拍、塔吉克、烏孜別克等民族自治州，並採取積極籠絡各族宗教首腦的辦法，透過他們來穩定信教百姓，各部宗教首領中的溫和派很多都接受自治區（州）的任命出任各級官員，此外不徵稅（指不向中央政府繳稅），不派餉這兩條讓自治區對於老百姓的吸引力就大大的增加了，周邊各地的少數民族百姓對於這場戰爭的最終勝利心中並沒有太多的疑惑，特別是其中原來就比較溫和的回部，眼下帝國政府又同意回人治回的思路，立刻就有越來越多的回部百姓湧入自治區，甚至玉門關內的很多漢人也開始前往自治區謀生，對於他們來說回部是一個被征服的異族，從警察到駐軍全都是漢家子弟兵，還有什麼好怕的？更何況這免稅的誘惑實在太大了。對於這些人口的流動，自治區政府與新疆辦事大臣左宗棠也取得了一致意見，在自治區內散發了大量介紹漢、回等各民族風俗的小冊子，鼓勵他們之間加強溝通，相互尊重彼此的生活習慣，避免不必要的衝突，同時左宗棠為了加快建立自治區治安體系，在奏請內閣批准後，下令從140師、150師中各抽調一個營的兵力在內地警察部隊沒有趕到前，擔負地區治安警備。
說實話這個民族融合地過程是緩慢而痛苦的。對漢人報有天生戒心的回部百姓與新移民而來的漢人之間彼此衝突不斷，剛開始的時候漢人往往吃虧大，但隨著漢人越來越多，這火拼的時候居然開始慢慢扳回劣勢，不過從總體來說，回部給政府造成的麻煩遠遠比更北邊地維部要少的多，在自治區政府與駐軍既安撫又打擊地手段之下。越來越多挑起民族對立的回獨分子被逮捕，慢慢安定下來的老百姓也不願意再讓自己的生活陷入動盪之中。當他們發現彼此之間的衝突透過上訴到自治區政府也能夠得到解決之後，參與械鬥的人越來越少，當然，這並非一天兩天的事情，實際上這用了近五十年地時間，時至幾個世紀後，帝國的老百姓對於他們皇帝處理邊疆問題仍然是褒貶不一。但有一點他們卻不得承認，現在的自治區實際上已經沒有漢、回之分了，兩族通婚的後代見證了整個民族融合的全過程。
就在帝國政府積極為收復北疆與內蒙而努