部分地區在當時屬於蒙古四大汗國中的察合臺汗國。東察合臺汗國，只不過這時史籍中更多是用亦力把裡這個名字稱呼東察合臺汗國。
明朝宣德七年、也就是亦力把裡分裂為亦力把裡、葉爾羌和土魯番三國，葉爾羌汗國的創始者賽依德，是東察合臺汗國滿速爾汗的三弟，他聯合另一兄長赫力烈在伊犁河谷和七河流域發動反對滿速爾汗的起義，卻被滿速爾汗鎮壓了下去，於是他逃亡到帕米爾高原並控制了費爾幹盆地，後來又逃往阿富汗的喀布林城投奔帖木兒的後裔巴布林。在巴布林的幫助下賽依德從中亞揮軍東進，重新統一南疆，建立葉爾羌汗國。葉爾羌汗國的首都在現在的莎車，鼎盛時期的疆域包括吐魯番、哈密、塔里木盆地：汗國版圖的東方是嘉峪關、南方是西藏、西南是克什米爾、西方與烏茲別克布哈拉汗國為鄰，與烏茲別克以費爾干納谷地為界，北方以天山為界，與東察合臺吐魯番汗國相鄰。在這一時期喀什噶爾、和田、阿克蘇重新拓展成為商貿繁榮的城市，這些地區的綠洲農業也得到了恢復與發展。新疆各族人民的文化生活此時也取得了重大進步，維吾爾傳統藝術“十二木卡姆”在熱西德汗時期由汗妃阿曼尼莎汗主持整理成型，成為一個體系。葉爾羌汗國信奉伊斯蘭教並逐漸形成了黑山派和白山派兩大教派：白山派的支持者主要是哈薩克人，而黑山派則主要是吉爾吉斯人支援。後來，土魯番汗國吞併附近的哈刺火州、柳城，日漸強大起來的土魯番開始同明朝爭奪位於如今新疆東部的哈密等衛所。
明王朝自明正統十四年年的土木堡之變後國力出現中衰跡象，儘管後來明朝又有過幾次中興，但始終無法恢復到洪武、永樂、
仁宣時期的強盛局面。與此同時西蒙古瓦剌部也日漸興起，於是在哈密地區形成了明王朝、瓦剌和土魯番三方爭奪的局面。明朝對嘉峪關以西的哈密等衛所的統治模式和內地不大一樣——明朝接管這裡後就讓當地歸附自己的蒙古人在盡忠臣服的基礎上繼續駐守。明成化八年土魯番趁明王朝和瓦剌在對峙中互相削弱的天賜良機出兵攻佔哈密，代表明朝駐守當地的蒙古王公罕慎向北京的大明朝廷求救，卻沒得到任何回覆，不得已之下罕慎聯合其他歸附明朝的蒙古部落同土魯番交戰。在歷經十年的激戰後罕慎成功收復了哈密，然而僅僅一年之後土魯番就設計擒殺罕慎，再次佔領哈密。這時恰逢明王朝在明孝宗的治理下迎來短暫的中興局面，於是明孝宗下詔書斥責土魯番，在明朝的威脅下土魯番被迫放棄已到手的哈密。四年後土魯番再次發兵攻佔哈密，這次明朝決定發兵教訓一下這個對手，於是甘肅巡撫許進率兵挺近哈密，從土魯番人手中收復哈密。土魯番並未就此放棄對哈密的野心，直到王越出任明朝三邊總制後屢次以重兵擊敗土魯番，迫使土魯番消停了十五年。正德八年土魯番策反了哈密指揮使拜牙，使其攜哈密重鎮投降土魯番，此後明朝再未收復過哈密。
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此時，金獨異霍行仲和銀獨異姚子騏二人，所攜眾門徒去的阿克蘇臺，土魯番統治下的天山山脈草原的西北疆域的中部，天山山脈中段南麓塔里木盆地北緣，東巴音郭楞，西接克孜勒蘇柯爾克孜，西南與喀什地域接壤，南與和田地區相望，北與伊犁的毗鄰，西北以天山山脈中梁與葉爾羌汗國統治下的吉爾吉斯斯坦、哈薩克相鄰。雄闊的天山山脈全長五千裡地，橫亙亞洲腹地為塔里木盆地和準噶爾盆地的天然分界線。天池處於天山東段最高峰博格達峰的山腰，距離(天山老城堡)約近三百里地，平面海拔一千多丈高度，素為有名的皇帝遊獵的勝地。
這個大駝隊一行三個多月，終於穿越了大沙漠、大戈壁灘、穿越了號稱“死亡之海”的