州大學伯克利分校、耶魯大學、麻省理工學院、麥吉爾大學等著名高校參觀。對於教育，不敢言通，只是有些拙見。且有感於中華科學的發展，遠遠落後於歐美諸國，所以想在回國後，結合中西所長，創辦一所新式的大學。現在，想把敝人心中設想的大學的大致情況，向在座的賢達作一個彙報，請方家予以指正。”
孫元起在原先的世界裡，從本科到研究生，在大學校園裡呆了七年，對於其中的情況雖然不能說了如指掌，但箇中窾要還是略知一二的，比如學科設定的情況、大學擴招的危害、教授聘任的利弊等。來到清朝，先後在京師大學堂、耶魯、mit、麥吉爾等中外高等學校任教，也大致知道學校的發展狀況。總體說來，二十一世紀大學的設定是科學的、合理的，只要糾正一些過火的東西，就可以移植到清末。當然，其中也要加入孫元起自己的一些東西，勾勒出自己心目中最完美的大學校園：
“新成立的大學，將以強國利民，推進科研為宗旨，以培養學術科研人才、及其他學堂教學師資、企事業技術力量為中心。從教育體制、培養層次、學科設定、學科體系、教學方式各個方面著手，努力達到世界同類學校的水平。
“在教育體制上，將是一所從普通教育到高等教育相對完整的學校。其中，普通教育將作為大學的附屬學校，保證高等教育的入學水準。普通教育中，除了暫時不設幼稚園，要包括三年制初等小學堂、三年制高等小學堂、三年制初等中學堂、三年制高等中學堂。高等教育，又分四年制本科教育、三年制碩士教育和三年制博士教育。
“本科畢業，即酌情授予學士學位；碩士畢業，授予碩士學位；博士畢業，授予博士畢業。
“小學階段，學科分國文、數學、科學、思想品德教育、體育五門。中學階段，分國文、數學、物理、化學、生物、歷史、地理、外語、體育九門。進入大學，開始分專業學習，除了國文、數學、外語、體育為必修外，專業科分為必修課和選修課。修滿足夠學科，予以畢業。
“按照國際慣例，學科分為哲學、經濟學、法學、教育學、文學、史學、理學、工學、農林、醫藥、軍事、管理、藝術等十三大門類。除了部分學科不開設外，新建立的大學在本科階段，將設立文學院、理學院、工學院、醫學院。文學院分中國語言與文學系、外國語言與文學系、歷史學系、哲學系、教育系等專業；理學院分數學系、物理學系、化學系、地理學系、生物學系等；工學院分電子學系、化學工程系、核工程系、地質學系、機械工程系等；醫學院分中醫系、西醫系、藥物系等。在研究生教育階段，設立研究院和國學院。如果說本科階段是負責學生的教育教學，那麼研究生階段將是負責學生的科研創新。其中研究院，主要包括理、工、醫、藥等學科。國學院則是專門負責研究中國的傳統文化，包括經學、史學、文學等。；
“除了博士教育採用推選方式外，包括普通教育在內的其他教育門類錄取，均採用全國統一考試、擇優錄取的原則。
“學校對所有學生免除學費，並根據成績優秀程度，給予相應的資金補助。學校接受社會捐贈，並且捐助可以指定具體學堂、具體學科專業，乃至建立相應的學校設施，包括大樓、圖書、道路、實驗裝置等。學校向捐贈人公示費用使用情況，但捐贈人不得影響學校所作出的任何決定。
“為學校捐助有力人士，及為學校建設做出傑出貢獻者，可以出任學校校董，校董對於學校發展和建設有建議權。
“普通教育，每年每級招收3個班，每班標準為15人，根據前一年的捐贈情況，可適當增加錄取名額，最高上額為25人。如果不足10人，則減少相應班級數。本科教育，每個專業每年錄取5人，同樣可以根據前一年的捐贈情況，適當增加