英國皇家學會那樣，只面向自然科學和工程技術；另一種是像法蘭西學士院那樣，涵蓋自然科學和人文社會科學，美國國家科學院、日本帝國學士院等都是效仿法國的。
“孫先生考慮再三，還是決定中華科學院效法英國皇家學會，只包括自然科學和工程技術。其主要原因是人文社會科學水太深，不像自然科學評定標準那麼單純。而且傳統人文社會科學，比如歷史、文學等，裡面的耆宿大儒、各種學派，孰優孰劣人言人殊，莫衷一是；而新興的人文社會科學，比如宗教學、社會學、民族學等，在中國才剛剛起步，根本無法獨立成為學科。所以中華科學院只包括自然科學和工程技術，至少短期內是這樣。”
歐洲分會的陸安對此甚為贊同：“中華科學院是應該只包括自然科學！畢竟自然科學更單純些，做出來的結果一就是一、二就是二，一目瞭然。如果別人懷疑，可以直接透過實驗驗證，簡單直接。而人文社會科學的問題誰說得清？比如現在文學界裡面，詩歌有宗宋、崇唐兩派之爭，南社與同光體辯論的不可開交；對於小說《紅樓夢》，尊之者稱為曠世傑作、有清三百年第一名著，貶之者則認為是誨淫之術，應該嚴厲禁燬；在文章上，則有《文選》派與桐城派的論訟，各方喋喋不休……如果中華科學院包括人文社會科學，只怕不出半年，就會被這班文人相輕的老夫子們弄得烏煙瘴氣、沸反盈天了。”
俞同奎道：“我國科學界之有孫先生，實在是莫大的幸事！他不僅培養了一大批科學技術人才，把我國的物理、化學、電子、天文等學科迅速提升到國際最高水平，而且他憑藉著卓絕的學識和人格魅力，成為中國科學界當之無愧的學術領袖。在他的帶領和指引下，中國科學界可以避免無數內耗、少走無數彎路，科研人員也可以專心致志投身於學術研究中去。”
現在網路上經常有人抨擊某某某是學霸、學閥，指責他們擠佔學術資源、霸佔學術成果、擾亂學術秩序、破壞學術生態等等，彷彿中國科學的落後罪責卻在學霸，學霸的罪行十惡不赦一般。固然學霸學閥有其惡劣的一面，但其良好的一面也應該客觀評價。比如提攜後進、指引方向、避免內耗，這就一個好學霸存在的重大意義。
比如全國法學學科排名第一的中國人民大學法學院，它擁有兩個教育部人文社科重點研究基地，即刑事法律科學研究中心、民商事法律科學研究中心，號稱是人**學的兩個拳頭。在2005年之前，法學院院長是著名法律史專家曾憲義，刑事法律科學研究中心趙秉志和民商事法律科學研究中心王利明雖然號稱一時瑜亮，在曾教授的領導下倒也相安無事。
結果2005年曾憲義卸任，王利明出任新院長，失意之下趙秉志憤而出走，率領盧建平、陰建峰、劉志偉、王秀梅等業務骨幹投奔北京師範大學，組建刑事法律科學研究院，自任院長。此舉當時被稱為“法學界震動”。儘管人**學院自稱後繼有人、影響不大，可是明眼人都能看出趙秉志出走對人**學院的巨大打擊，至少讓它的刑法學科在三五年內翻不過身來。
何育傑贊同道：“那是自然，孫先生出任中華科學院院長既是名至實歸，也是眾望所歸。除他之外，誰當這個院長我都不會服氣，相信科學界也不會答應！”
虞和欽又問道：“那科學院院士如何遴選？是否像日本帝國學士院一樣，有名額限制？”
日本的帝國學士院，在1879年設立時名為“東京學士院”，會員定額為40人——當然，這很明顯是照搬成立於1635年的法蘭西學士院，包括人員數量限制。這種定額意味著學士是終身制職位，只有在某成員去世留下空缺時，才透過全體成員投票選舉新成員。1906年，東京學士院改名為“帝國學士院”，定額也改為60人。1925年，定額變成100人。