日本還以科學研究為名，把數以萬計的朝鮮文物古籍運到日本國內，這些都是朝鮮的國寶。朝鮮寺廟也未能倖免，精美的佛像和銅鐘被運到日本，一切金屬宗教法器都被搶走，用於鑄造武器。
滿鐵、三井和三菱等日本大企業以研究中國為名，派出了大批情報人員，打著“學術”的幌子，對中國各地的資源進行了調查。
滿鐵在上海、南京、杭州、廣州、香港等地設立了分支機構，中國各地的工農業產品、政府和民間的財富被他們偵查得很清楚。這些所謂“學者”後來成為了金百合計劃的執行者，隨著日軍的鐵蹄前進。
關東軍發動九一八事變的第二天就佔領了瀋陽銀行大樓、邊疆銀行和東三省銀行的金庫。佔領東三省後，日本憲兵隊洗劫了所有的省行以及各地支行，將大筆黃金及貨幣據為己有。
日軍偷襲珍珠港後，用5個月的時間席捲東南亞，佔領新加坡後，軼父宮在新加坡建立了金百合計劃的地區總部，不吉隆坡和檳榔嶼作為搶劫贓物的中轉戰。
在吉隆坡馬來西亞中央銀行金庫，日本人搶到了許多金磚，每塊重6。25公斤。他們還從馬來西亞各省的馬來酋長和華僑手中搶到了大量金磚。
東南亞很多富裕的信徒用黃金鑄造成佛像，為防盜竊，他們在佛像外面敷上石膏。日軍把大量佛像推倒砸開，被他們奪走的黃金佛像，單單在緬甸就有8噸之多。1942年7月，日本人搶到了一尊4。5米高的金佛。
當時菲律賓國庫中有51噸黃金、32噸銀塊、140噸銀幣和2700萬美國財政公債，還有大量寶石和有價證券。這些財富除一部分銀幣外，全部落入日本人之手。
日軍包圍了上層人士和中產階級住宅區，迫令其離開住宅。隨後憲兵入室洗劫資產，一切值錢物件以及金屬製品被洗劫一空。他們還經常搜查平民，以獲得藏匿的黃金和寶石。
大量的日本銀行職員被派到東南亞各地，協助日軍清理當地銀行賬目，尋找出被隱藏的帳戶和財產。日本人用刑訊等手段迫使當地銀行工作人員交出秘密庫房和保險箱的鑰匙，拒絕合作者大都會被折磨至死，利用這種方法，日本人在爪哇銀行一次就得到5200萬荷蘭盾現金。
日軍還透過大規模綁架勒索、強制勞工、建立賭場和妓院等罪惡的場所掠奪財富。除了**裸的搶劫外，日軍每佔領一地，就發行沒有任何信用和資本儲備的軍票，強制流通。透過這種方式，他們獲得了大量物資以及大量佔領地的貨幣。
佔領東三省後，設立滿洲國中央銀行，發行佔領券作為新貨幣，強迫中國居民把有價值的中國貨幣兌換來的中國貨幣從中國套取戰爭物資。日本人在東南亞如法炮製。不斷加大軍票發行量造成通貨膨脹，軍票信用度不斷下降，當一種軍票喪失信用時，日本就用新的軍票代替舊軍票。
在華北，渡邊亙大佐採用威脅閹割有錢人長子的方法勒索了大量黃金、珠寶和藝術品。在新加坡，遷政信大佐用暴行開路，1942年2月21日開始，他下令對新加坡華人進行大屠殺，馬來半島共有4萬華人被屠殺。
接著他要求華人向天皇貢獻5000萬日元“贖罪費”處於驚恐中的新加坡華人無法在短期內籌集到如此數額巨大的款項，他就替華人向橫濱正金銀行貸款，用這筆巨大的財富，送給天皇作為禮物，然後強迫華人交出大量金磚和外國硬通貨以及有形資產。
日本軍隊和黑社會還建立了慰安婦制度，從亞洲各國，主要是朝鮮和中國徵發婦女充當慰安婦。據估計被迫害婦女多達20萬人。這些婦女用**換來的骯髒的錢也流入了日本軍國主義者手中，成為金百合計劃的一部分。
中國的國寶，人類學歷史上最珍貴的北京猿人頭蓋骨和牙齒可能被日本侵略