廣西桂平紫荊山區傳教獲得成功，信徒日增，形成“拜上帝會”，他被奉為首領。
在廣西，洪秀全與馮雲山共同策劃，制定了宗教和道德的戒律“十款天條”和各種儀式，組織和約束拜上帝會會眾。由於影響不斷擴大，拜上帝會與當地封建傳統勢力發生衝突，鬥爭日劇。其間，洪秀全與馮雲山及廣西人楊秀清、蕭朝貴、韋昌輝、石達開形成領導核心，逐漸明確了推翻不信上帝的清朝統治者而另建新朝的目標。洪秀全自稱天父次子、天兄耶穌胞弟，其餘五首領併為天父之子，以堅定信徒信心。1850年夏，廣西天地會群眾的自發鬥爭達於高潮，清朝在廣西的統治瀕於癱瘓，洪秀全乘機通知散居各地的信徒到桂平金田村會合。半年間，會集萬人，編組成軍。1851年1月11日建號“太平天國”，稱天王。同年，設官封王，建立各項制度。1852…1853年（咸豐二年至三年），統帥所編太平軍與清軍作戰，入湖南進湖北，沿長江攻佔南京建都（號天京），統治長江中下游廣大地區。
建都後，洪秀全頒佈了《天朝田畝制度》。這一檔案勾畫出他理想中的社會藍圖：實行“凡天下田，天下人同耕”，每人都授與土地，不論男女，照人口均分；以古代《周禮》的制度編組戶口，每二十五家為一“兩”，為管理生產和分配的最基層的組織；每“兩”設一國庫，收成時，除足本“兩”人戶口糧外均歸國庫，每“兩”人戶婚娶彌月所需俱用國庫，鰥寡孤獨由國庫供養。這是建立一個平均的、自給自足的、公有的小農社會的理想模式。但洪秀全的這種構想並不很縝密。1859年輔政的洪仁�岢觥蹲收�縷�罰�髡判稅旖煌ā⒁�瀉塗笠檔齲�搿短斐�錟噸貧取返那閬蟯耆�煌��樾閎�才�就�狻Ｒ院笥種匭驢�肌短斐�錟噸貧取罰��渲兄饕�諶萑縉椒滯戀氐炔⑽詞敵小Ｔ謁枷胛幕�矯媯�樾閎�隕系畚�酪徽嬪瘢�蚧鞣稹⒌酪旖蹋�誚ǘ繼煬┖笥址⑵鵒搜轄�磺鋅酌現鈄影偌沂榧�腦碩��輝市砘�澆痰男隆⒕稍際ゾ�吞�教旃�嘈吹氖榧�鞔��醞技憂克枷臚持巍Ｑ鈽闈宸炊哉庖徽�擼��1854年2月以天父下凡方式肯定四書、十三經及其他古書的價值。洪秀全遂下詔刪改四書等儒家典籍，宣佈刪改後準人民閱讀。但此事迄未完成，終太平天國之世並未出版改定後的四書、五經，洪秀全本人對古人古書的嚴厲態度也沒有改變。與此同時，洪秀全還提倡文以記實，反對浮文典故。
第三隻眼看洪秀全：（2）
1856年9月，太平天國發生內亂。主要問題發生在楊秀清同洪秀全和其他高階領袖之間。洪秀全雖是天王，但楊秀清掌握了軍政實權；並常以天父代言人之名，超越洪秀全之上。韋昌輝在洪秀全的默許下（一說系奉洪秀全之命）殺楊秀清；又擴大事態，濫殺楊秀清部屬多人。洪秀全在石達開起兵威脅下，殺韋昌輝，以石達開主政。但旋又對石達開心存疑忌，多方牽制，致石達開於次年帶兵出走，與洪秀全分裂。此次內訌，極大地打擊了太平天國，損傷了實力。1858年，洪秀全重建領導核心，提拔後起的陳玉成、李秀成、李世賢等為方面軍統帥，自己兼任軍師。但鑑於楊、韋、石事件，家天下思想加重，多任用年幼無知或才幹不足的兄弟子侄，使領導機構的能力大為降低。1859年，任命新到天京的族弟洪仁��熬�揖�Ω賞酢保�佑謔贅ǖ匚弧：槿詩頗具政治資才，但與太平天國淵源較淺，引起宿將不服。洪秀全遂普遍加官晉爵，以團結人心，雖收到暫時效果，但卻導致了各將領踞地自雄的局面。
洪秀全在太平天國中致力宗教甚於實際政務，即使在後期親掌大權時亦如此。太平天國內亂後，軍民產生失望和離心傾向。因此他更進一步沉溺和求助於宗教，親自反覆宣傳天父天兄與其父子為“父子公孫”三代，其父子受天父天兄安排坐江山，