神均是牽扯其中，三界烽煙燃起，血流成海，歷時十數載。黃帝與刑天約戰常羊山，力斬其首，本以為三界就此安寧，何曾想刑天魔功大成，竟是不死，復又昂然起身，以乳為目，以臍為口，操干鏚以舞，兇威震天，眼看黃帝都是不敵。
一直隱於完神天界，超脫一切的三清尊神、西天如來得見刑天魔威，終是趕來出手相制，助黃帝將其誅滅。卻不想刑天肉身雖滅，魔心不熄，三界再無可去之地，他毅然將元神遁入那充斥黑暗邪力的魔界之中，而死心追隨刑天的仙凡之輩也是義無返顧的投身妖魔界。
至此混沌天地又是真正多出了一個嶄新界域——妖魔界。由於刑天失卻肉身，又是被黃帝大傷元氣，遁入妖魔界後便休生養息，蟄伏積蓄，諸界終是得以安寧。二次天命之劫因三清佛祖大能而渡，可諸界安平又能維持多久呢？
經刑天與黃帝一戰，完神天界之中死傷神人無數，黃帝隱退，傳位於昊天金闕至尊玉皇大帝，由三清尊神輔佐之，以期再興完神天界，引出封神之戰……
時值人間百廢待興，紂王當權，原始尊者賜愛徒姜子牙持封神榜下凡來到人間，為三界興替演化因果。
紂王本非無道，只是那妲己妖媚惑主，把持朝綱，終是引來諸侯不滿，神州大地戰禍紛起，姜子牙順應天命輔助周朝，請來人間修真者乃至上界仙家下凡助力，使得原本處於劣勢的周朝反倒是高歌猛進，長驅直入朝歌，大有一舉功成之勢。
孰不料完神天界之中，截教之主的通天教主與原始天尊一語不合，起了心思。誘使申公豹下凡與姜子牙作對，無數妖修紛紛投效紂王，與那周朝大軍展開對決，封神榜上篆刻之人名一一於戰事之中顯現，或一縷幽魂投入那封神臺上，或肉身成聖大興周朝，一切的一切始終逃不開天地因果，縱是那三清之一的通天教主也算不清自己在這封神之戰中扮演著什麼樣的角色。
歷時十數載，終以商紂大敗，紂王自焚為封神之戰劃下了一個並不如何完美的句號。至此三百六十五名榜上有名者得封正神，接引完神天界，其中有人間界的道家修士、妖修、魔修，亦有上界仙人、闡教門人、截教弟子，人員之繁雜，難以估量。便是連那紂王也得以封神入位。
更有無數修真者、仙人乃至神人因封神之戰而亡，成為三次天命之劫的犧牲品。三百六十五位正神各司其位，由昊天金闕至尊玉皇大帝一統之，紫府上界與完神天界漸有二合為一之趨勢，天庭漸漸成形。
事隔千數載，公元184年，人間戰亂再起，三名修真者張角、張寶、張梁逆天而行，起“蒼天已死，黃天當立”所謂世間大義為旗，欲雄霸世間稱王。因此引發天命第四劫悄然而現。
由於天庭初建，上界仙神均是各自為政，彼此嫌惡，恰逢人間因修真者入世而大亂，各路仙神下凡引渡有緣之人證天道，化業力，渡輪回，入世參戰。這也導致人間界因仙神之流插手得成三國鼎立之局。
魏有那太白金星首徒司馬懿坐鎮；蜀有那文曲星投胎轉世神算諸葛運籌帷幄；吳有那北斗七星下凡鼎力襄助。
凡人之戰竟是漸漸演為上界仙神暗中鬥法，間中更是有那諸多散仙遊神之流悄然下界，左慈、管絡，華佗，南華老仙便是個中翹楚，也是將本就已經夠渾的三國亂世攪得亂上加亂。
人間界生靈塗炭，無數戰死怨魂被那九幽之下的妖魔界吸去，無形之中助長了這一蟄伏已久未知界域的氣焰。
天庭之主昊天金闕至尊玉皇大帝得三清尊神相告知曉此乃天命之劫初現之相，需以大仁義，大智慧，大德行方可化解，心生應對之法。玉帝先是動用帝王之威，強懾那襄助吳國的北斗七星君上界飛昇，又是下入地府邸，向那掌管六道輪迴的十殿閻羅求助，改了生死籍，把那文曲星轉世之不世奇才諸葛亮