將亞當的胚胎和量產機融合的原因還要從古代說起。新世紀福音戰士的故事其實從遠古時期就開始了，那個時候地球上還並沒有這些巨大生物。藭
直到一顆隕石墜落在了地球之上，墜落的位置是南極，而隕石則帶來了亞當，天生就擁有著生命果實。亞當又生下了17個使徒，他們也都各自攜帶有生命果實。
而後又一顆隕石墜落在了地球之上，那顆隕石之中是莉莉絲，他擁有的則是智慧果實，她並沒有生下孩子，但墜落之後身體內流出的鮮血淌滿了海洋，而正是這片鮮血海洋之中孕育出來了地球上的眾多生命。
因此，不只是人類，地球生態圈中絕大多數的物種都蘊含著智慧果實的碎片。
而當智慧果時與生命果實相互結合的時候，就足以誕生出堪比神明的存在。只不過單個人的智慧果實相比於使徒和亞當的生命果實來說，實在是太微量了，並不足以成神，因此人類在嘗試在南極進行實踐，將人類的基因注入到亞當體內的時候，並沒有創造出一個神明，而是引發了第二次衝擊。
如今將亞當的胚胎融入到量產機之中，其實也是在進行類似的行為。亞當的胚胎之中有最大的一塊生命果實，而之前的戰鬥中就已經證明了，在量產機體內的傀儡系統中，有綾波麗的克隆體，而裡面蘊含著的，則是莉莉絲的一部分靈魂。
劇場版之中，碇真嗣能夠觸發第三次衝擊，就是因為那個時候的初號機已經湊齊了s2機關，自身是亞當身體的一部分，而他要救出來的正是綾波麗的靈魂，三者組合在一起，恰好就引發了第三次衝擊。
而即便是三者並沒有完全湊齊，當智慧果實與生命果實結合在一起之後，依舊可以獲得無比強大的力量。藭
量產機的體內本來就有量產版的s2機關，雖然不足以完成補完，但也足以為這強大的力量提供足夠的能源。
莉莉絲的殘骸旁，五臺量產機圍繞成一個五角星的形狀，看起來彷彿是在進行什麼神秘的宗教儀式一般，而他們則依次將手掌伸入了自己的體內，從體內掏出了自己的s2機關，隨後將他們全部都送到了中央的一臺並沒有被啟動的特製量產機的體內。
這臺機體比起另外幾臺量產機明顯高出一頭，身材也顯得更加粗壯，五個s2機關同時塞進他的體內，也不會顯得臃腫。
而隨著這臺機體獲得能源，淡金色的光環在他的頭頂一閃而逝，但很快就像是訊號不好一樣，閃爍了兩下，又消失掉了，隨後一股無形的力場將整個地下世界籠罩。
圍繞著他身邊的舞臺量產機，身上的血肉就好像是融化了一般，朝著中央的那臺機體匯聚了過去，隨著血肉匯聚到那臺機體之中。本來就已經無比強大的at力場，增強到了更加誇張的地步。而機體的體積似乎並沒有增大，但隨著他脈動腳步，在地面發出沉重的聲音，可以明確的讓人認識到，機體的體積雖然沒有變大，但質量卻是實打實的增加了。
“成功了？”機體的上空石碑詢問著。
“並不能算完全成功。”另一個石碑回答：“傀儡系統並不足以掌控這麼強大的力量，所以他是失控的。現在他應該要來摧毀我們了。”藭
“看起來是這樣，但內建的程式已經寫入完畢，下一個輪迴世界會按照我們的預期發展的，而他也終將奪取初號機的s2機關，替我們完成最後的補完。”
石碑們相互進行了短暫的交流，緊接著一股無形的力量就擴充套件開來。雖然他們的本體並不在石碑之中，但隨著這股力量擴充套件，他們的思維容器也同樣遭到了破壞，石碑一塊塊暗淡下去，上面的花紋也逐漸消失。
最終變成了一塊塊慘白色的空白石碑，看起來就像是他們最後的墓碑一般，而融合了亞當胚胎的量產機，似乎是感到了迷茫，對