另外宋楠也清楚，錦衣衛中混雜了不少其他部門的耳目，譬如東廠的耳目，不但總衙有，京中有，各地的千戶所中也肯定不少，宋楠豈會容忍有這些人存在。
九月中旬，宋楠下達了清空空額編制的命令，數千拿錢掛職卻不幹事的錦衣衛官員被一併裁退，一時間哀鴻遍野，震動京師；很多人託著各種關係和名目來打招呼求肯，被宋楠一概拒之門外；事情很快便被捅到了正德那裡，但正德有言在先，不干涉宋楠對錦衣衛衙門的整飭，就連劉瑾也不出一言。
清退這兩千餘空額之後，光從經費開支上便每年可省出近十萬兩銀子的費用來，用來填補正常衙門剋扣的餉銀雖然稍顯不足，但起碼聊勝於無。
更重要的是，這些空額大多是百戶旗官等小官職，如此一來等於讓一大批錦衣衛緹騎有了晉升的空間，所起的積極效果遠甚於節省下來的費用。
緊接著便是對於錦衣衛內部的肅清，宋楠派出二十一隻內部督查組進駐京城和各地衙門中，採取公開和不公開兩種方式進行稽核肅清。
針對的無非是兩種人，一種是辦事效率低下，人浮於事混跡其中的錦衣衛人員，另一種則是混跡在錦衣衛內部的耳目；所謂公開的方式便是張貼總衙限期自查公告，言明在九月三十日之前，所有之前有過過錯的錦衣衛官員必須主動找稽核督查組坦白交代，但主動交代者，重案從輕，輕案從無，既往不咎；但凡過了期限者，一旦查實，一律從重從快處置。
非公開的方式便是讓各衙門中人暗中舉報，舉報查實，從重處理，舉報之人獎勵升職。
這又是一枚重磅炸彈在錦衣衛衙門中炸響，一時間錦衣衛上下人心惶然，個第二九七章清洗
個自危；錦衣衛中的官員和緹騎何曾經受過這樣的大地震，很快便有人領頭開始抗辯，找到內外廷各衙門投遞各種針對宋楠的詆譭之言，稱宋楠搞亂錦衣衛衙門，胡亂羅織罪名，弄得天怒人怨云云。
這些事很快又經由各人之口捅到正德耳邊，正德也有些坐不住了，對宋楠的行為他很是不解，這般鬧騰起來，對宋楠穩定立足於錦衣衛衙門似乎並無好處。
宋楠在正德詢問此事之後只是給予一句話的回答：“不破不立，皇上若信臣，便讓臣繼續下去，所有的指責，我都將以證據來說明，若臣有偏頗之處，臣自然會引咎辭職。”
正德無可奈何，他不是責怪宋楠整飭衙門內部，而是不想他這般大張旗鼓，弄得人人來找他訴苦，見宋楠態度堅決，正德便眼不見心不煩，索性所有關於錦衣衛內部整飭之事的奏議一概不予回覆，只要宋楠擇機在早朝上針對群臣的疑問給予集中作答。
宋楠自然不會含糊，他知道越是壓力大，便越說明錦衣衛衙門需要整飭，既然握著錦衣衛衙門，便要將其經營成鐵桶一塊，否則自己便無強力安身立命的資本。
歷經兩個月的大清洗，一共處置和清退上下官員緹騎一千六百餘人，總衙和南北鎮撫司特設的督查公房內案卷堆積如山，在十月下旬的一次早朝上，宋楠命人將所有卷宗用大車拉到奉天殿上，花了兩個時辰的時間，對被處理的人員一一加以說明，面對強大縝密的證據，很多人自覺的閉上了嘴巴。
其實眾人心知肚明，宋楠之所以這麼做，就是在鞏固自己的錦衣衛指揮使的地位，每一任指揮使上任都會來這麼一手，只是沒宋楠這麼激烈罷了，也並不值得大驚小怪。
錦衣衛衙門設立近百年時間，這麼個老衙門中自然是積弊沉珂甚多，人事又複雜，新任指揮使上任，總要動一番手腳才能立威。本稀鬆平常，但不知為何，好像宋楠這回引起的關注更大，總有人將這些錦衣衛衙門內部的事情放大捅出來，弄得好像關乎朝廷大局一般，明顯有人在推波助瀾。
當然具體是誰，