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的確，自然界的動植物有許多千奇百怪的本能。有的動物具有很高的預測能力，例如，在中古時代，歐洲有些人如果想知道冬天的長短，往往會用鐵鍬挖開土撥鼠的洞，看看土撥鼠的存糧情況，如果洞中存糧比往年多，則意味著即將到來的冬天寒冷而且漫長，如果存糧很少，則意味著一個暖冬。一些植物也有預測能力，例如，老鄉們常常在春天觀察梧桐樹的花色，如果花色赤紅，則年景必旱；如果花色淺白，則年景必澇。有些植物甚至還懂得曆法，梧桐樹葉平年為12，遇閏年則為13。
除了以上本能，動物還有自救的本能。中國醫書記載，古代人用沾上毒藥的弓箭來獵殺老虎，可老虎中毒箭後，會食用清泥來解毒；雉被鷹在空中抓傷後，會飛到地面上，到處找地黃（一味中藥），並將地黃葉貼到傷口處。有人曾做過這樣一個實驗，以礜石毒老鼠，老鼠中毒以後像喝醉了酒，也不怕人，但它們還是會找泥湯處，喝上幾口，一會兒就沒事了。
現代研究表明，任何一種動物都有一些自救醫療的方法，比如，蛇是冷血動物，但當受到外傷而感染時，它會找到一處太陽光充足的地方，躺下來讓陽光直射身體，為的是使體溫升高2—3度。美國羅維雷斯研究所的生理學家馬特·克魯格認為：“已經有大量證據表明，支援發熱是一種針對感染的防禦性適應，在整個動物界已經存在了億萬年之久。”他認為，用藥物控制發熱，有時反而會使病情加重，甚至致命。他在實驗室裡蒐集了一批重要的證據：當蜥蜴被感染時，會選擇一個溫暖的地方使體溫升高一些，大約20℃左右，如果找不到一個能使體溫升高20℃的溫暖的地方，則蜥蜴多半會死去。小兔不能自己發熱，因此一旦患病，它也會找一個暖和的地方去升高它的體溫；成年兔能自行發熱，一旦被退燒藥阻斷，也多半會死去。
然而，動物本能與中醫起源有內在邏輯關係嗎？我們看不出什麼關係，這就好比“風馬牛不相及”。如此類比是可笑的。比如說，現代科學新成立了一個學科稱為“未來學”，當我們討論其起源的時候，是否要這樣說：未來學起源於動物的本能。因為上面舉到的例子中，動物的預測能力並不比人類差。如果將這一類比推廣開來，你會得出一個笑破肚皮的結論：人類的所有文明都起源於動物的本能。
再說，直接以植物、動物、礦物入藥並非中國所獨有，世界其他民族也有，例如，甘草、大黃、食鹽、膽礬等，不但中國有，西方國家也有。此外，中國其他少數民族也有自然藥物，例如，蒙藥323種，藏藥404種……這些藥物中有許多與中藥是相同的。不同的是，漢民族中醫的自然藥使用，是按照中醫的基本理論進行的，在這個意義下，自然藥才能稱之為“中藥”，否則也就無所謂中藥了。藥，本無中西之分，就看以什麼樣的原則來使用。
可見，中醫的形成一直在理論的指導之下，離開了理論，中國的古代醫藥就不能稱為中醫，只能與世界其他民族一樣。如此研究，必然會得出中醫不存在的結論。
或許有人會說：中醫的實踐與理論的關係應該是這樣的，我們的祖先在長期的實踐當中，首先積累了大量自然藥物以後，然後才總結髮展出了一套精深的理論。所以中國醫藥稱為“中醫”是很晚的事，大約在戰國以後。而在那以前的漫長曆史時期中，中國只有巫醫，只有經驗醫學。
這個觀點恐怕是現代學者們的主流觀點，它符合漸進的思維模式，也符合常規文明起源的解釋。但我們認為它還是不正確的，因為有兩個問題它無法解決：
第一、中國醫學的歷