李璡分配好兵士的田產之事，穩定軍心後，就佯裝中計，以採購戰馬為由出京，之後就失去了蹤跡。
不久，李祖述就帶著李璡的信物找到了申湛然，要求申湛然配合他的行動。
申湛然初時佯作不肯，不過當李祖述拿出李璡盜取太倉庫銀的證據，以及李璡送給申湛然、劉文炳等人的記錄後,申湛然表現得十分憤怒，同時也故意顯露出一絲軟弱。
李祖述見狀，又趁機勸解申湛然，告訴他,崇禎既已得到朱元璋的兵法真傳，恐也繼承了對方的殘暴。
並歷數洪武年間朱元璋誅殺的功臣勳貴，示意崇禎絕非他的最佳選擇。
隨後又特意提醒申湛然，別看他現在風光無限，一旦掃除叛亂，就是他命隕之時。
其實申湛然在張應京之事後，心中就一直有些擔心，此刻聞言，立時表現出猶豫之色。
李祖述見狀,又趁機遊說，並許以重利。
申湛然藉機打探詳情,李祖述只是隱諱告訴他，說自己南京方面有人，定可保他富貴。
申湛然試探無果，只得佯作無奈地應了下來。
不過他為免李祖述生疑，也知對方一直在打太倉銀子的主意，就又佯作不甘，假裝想抹平李祖述製造的貪墨痕跡，給對方製造機會。
這才有了他向朱元璋請旨，撥付五十萬犒軍之事。
果然，當他的書信傳出去後，太倉不久就失了火，之後便是轉移庫銀之事。
申湛然雖不知李祖述會如何盜取庫金，但是他知道對方一定會動手，所以他也一直緊緊地盯著此事。
沒想到庫銀進入常盈庫才兩日，他就發現庫銀已經被調包了。
申湛然發現此事後，心中也有些著急。
因為他知道這批銀子事關重大，同時也不知該相信誰。
不過他是有韜略，也是有擔當的人，驚慌過後，便不著痕跡地瞞下一切，暗中查訪。
他因擔心李祖述借運糧之機將銀子運出城去，還特意讓朱慈烺下令，暫停運糧外出等事。
申湛然本以為李祖述會來找他相助，沒想到對方卻並未前來，這不禁讓他有些疑惑。
不過最後李祖述還是來了，卻不是要求他幫忙運送銀子，而是要他不要再查潛伏在京城外的兵馬。
直到此時，申湛然才知李祖述從未相信過他，只是故意給他一些假訊息，誤導他的判斷。
因此他明面上調回了香河那邊的錦衣衛，暗地裡卻又讓劉文炳的人去監視，不過卻一直沒有發現什麼異常。
之後李祖述又找到他，告訴他朱元璋已死，讓他協助奪取政權。
而且這次李祖述還一反常態，告訴了他行動計劃。
申湛然自不會相信李祖述，不過卻仍答應了下來，並煞有其事地指出了其中的不足之處，弄得李祖述頗為尷尬。
之後自然是計劃有變，申湛然佯作不知地指揮人平定叛亂，卻故意沒有抓捕李祖述等人。
一來是他要留條活路，以免斷了線索，二則是擔心逼迫太急，李璡會有安危。
不過朱元璋的突然出現打亂了他的部署，同時他也發現朱元璋對他的不滿，可惜此刻的他已是有口難言......
朱元璋聽著黃尼麓的講述，才知李璡和申湛然竟是在下一盤大棋，心中震驚之餘，也有些擔憂。
因為李璡未告知他詳情，確實是為勢所迫。
可申湛然並非沒有機會，但他卻沒有說破，恐也有藉機試探的意思。
畢竟他前世殺戮無數，儘管他有苦衷，覺得並非濫殺，但是對於朝廷官員來說，他的殺戮之氣確實太重，心中有所擔憂倒也正常。
現在雖說沒有人知道他的身份，可是他