雖然mei博士的行動很快，但是透過克萊因連線接管普羅米修斯的她終歸要比侵蝕之律者慢上一些，當mei博士重新奪回整個基地的控制權時，第十二律者已經啟動了核彈發射井，對人類文明最後的三座城市發動了攻擊。
人類只剩下三萬個體，文明已經名存實亡。
在櫻死後，六位融合戰士僅剩五位，而原本負責製作神之鍵的維爾薇因為不明原因在完成了第一神之鍵虛空萬藏之後放棄了自己的原定計劃——將第二神之鍵千界一乘提升到另一個境界。而是向mei博士提出申請，自願執行延續人類文明火種的‘方舟計劃’。
方舟計劃是令執行人攜帶人類基因文庫乘坐飛船離開地球去往宇宙尋找新家園的一項計劃。但是其實質是由執行者離開地球，躲入黑暗之中等待迴歸的機會，如果人類文明消亡，就利用這些基因創造出新的人類文明。
說好聽叫文明的後路
說不好聽一點，就是逃兵。
至此，人類還剩下最後四位融合戰士，而根據mei博士和普羅米修斯的計算，最後的最強大的律者，第十三律者，被稱之為‘終焉之律者’的敵人將會在月球上甦醒，距離她誕生的日子已經越來越近。
迎戰終焉的日子迫近，梅比烏斯博士認為將律者核心製作成神之鍵的手段實在是太過於暴殄天物，為了跨越界限，讓自己抵達更高一層的境界，梅比烏斯博士用侵蝕之律者核心在自己身上進行實驗，卻被侵蝕之律者排斥而無法成功。
然而在梅比烏斯嘗試著在華身上進行實驗的時候，侵蝕之律者居然並沒有對華產生排斥反應。
華能夠感受到自己的意識沉入深邃的黑暗，不知道是海洋還是宇宙，有著某種未知的東西在呼吸，她能夠感受到某種力量切實的存在，並且就在不遠處。
她坐起身來，只看到了一片茫茫無際的白，就像穿行在精神世界中的那時候一樣，只不過精神世界的顏色會因人而異。
當她起身時，向前邁出那一步，便看到突然出現在正前方的另一個自己，它和華有著完全相同的形狀——那只是一團表現出華樣子的人形光芒。
只是看著對方，華就能感受到自己心裡陰暗的瘋狂生長，伴隨著那可怕念頭的異化，華也明白了這和她一模一樣的光究竟是什麼人。