傷，不得不提前回國大修。隨後的一天，德國空軍更是一口氣炸沉2艘英國巡洋艦和2艘英美驅逐艦，還對克里特島的海港設施進行了猛烈轟炸，試圖切斷陸海聯絡。
面對不利的海空局面，弗萊伯格少將萬分著急。於是立即糾正戰術，採取白天防守，晚上集中優勢兵力只進攻一個地區的辦法，準備靠人數優勢和夜晚德國空軍出動困難的機會奪回機場。在他的指揮下，盟軍在九月六日凌晨三點，終於奪回了伊臘克林機場，但也有整整三個團被德軍包圍殲滅。
斯圖登特聞訊後意識到不妙，於是立刻讓東南艦隊出發，護送8000名山地兵和重型裝備上島。德國東南艦隊是一支七拼八湊的艦隊，總計有70艘艦船和約200艘摩托艇，主要戰鬥力是義大利提供的1艘重巡洋艦、4艘驅逐艦和繳獲的希臘2艘驅逐艦。至於摩托艇更是不能帶重型裝備，真正的輸送核心是仿造中國的33艘人員車輛登陸艇。但德軍也非常混亂，首先登陸艇需要透過鐵路運到希臘，但由於運輸時鐵路線被炸斷，所以只到了23艘。而且德軍後勤部門把柴油放在最後的火車上，以至於出發時登陸艇居然還沒加油。
一直到晚上八點，斯圖登特都沒等到柴油，不得不讓艦隊和摩托艇前出發，這意味著7千名山地兵將在白天登陸。九月七日上午九點，東南艦隊抵達克裡特島外海。即將上岸時遭到了蒙巴頓的伏擊。整整48艘艦船和摩托艇被擊沉，2300名山地兵因此死亡。不過蒙巴頓也沒好到哪去，ju87斯圖卡告訴他一個道理，永遠不要在沒有制空權的情況下暴露艦隊。下午一點，斯圖登特派來的112架ju87發現了迂迴的蒙巴頓，雖然英國空軍和陸航竭盡全力，但馬來亞號戰列艦依然被4枚炸彈重傷，還再次損失包括1艘重巡洋艦在內的8艘艦船。短短三天，英美地中海艦隊就損失3艘戰列艦、4艘巡洋艦、5艘驅逐艦、2艘炮艦和3艘潛艇，其中9艘被擊沉！坎寧安沒法堅持了。要知道東地中海總計才4艘戰列艦和7艘巡洋艦，現在居然就剩1艘戰列艦和3艘巡洋艦可用，再打下去遲早全軍覆沒，所以他只好發電報給丘吉爾，請求中國海軍印度洋艦隊和空軍支援。
楊秋沒有拒絕，問題是第三艦隊（外稱印度洋艦隊）正在準備進攻馬六甲和緬甸的關鍵時刻，大部分艦船都在查戈斯待命，即使趕過去也要六天。而駐紮在波斯灣的空軍也已經調走很多去印度，最後只能湊出32架雷電和6艘驅護艦趕往塞普勒斯。但此時已經晚了。陰差陽錯晚出發五小時的23艘登陸艇帶著17輛四號坦克，已經衝上克里特島的淺灘。
德國海軍本來沒有專用登陸艇，直到中國用登陸艇強渡巴爾喀什湖，才讓希特勒感興趣。於是找到哈坎，在籌備海獅計劃時建造了三艘與天山級相當的坦克登陸艦和百餘艘中型登陸艇。戈林在英吉利海峽差點敗光德國空軍的家底，西班牙又出亂子，希特勒只好無限期推遲海獅計劃。於是這批軍艦一直停泊在基爾港生鏽，直到這次要登陸克里特島才想起來。區區17輛四號坦克，放在別的地方獲取連泡都冒不出。但克里特島的盟軍此前在希臘丟了全部重型裝備，繞道南非的船隊又沒到，所以島上只有4輛十字軍i型巡洋坦克。面對數量質量都佔有的德軍坦克，4輛十字軍很快就被消滅乾淨。到晚上，德國東南艦隊捲土重來，這次它們拖來三艘塞滿坦克和88炮的大型駁船，一口氣向島上輸送了28輛坦克和12門88炮，還有3500名山地步兵。
勝利的天平快速倒向德軍，弗萊伯格見敗局已定，只好提出撤退儲存實力。但丘吉爾依然不服輸，拒絕了撤退的要求！這種頑固葬送了部隊，戰爭第五天，上島的德軍總兵力已經增至3萬5千人，還有2500名義大利傘兵也在隨後趕到。
弗萊伯格清楚，克里特島不可能在守住了，面對丘吉爾的