但是，由於美蘇對中國政府的認同不一，在邀請國、共哪一方出席舊金山會議的問題上雙方發生了爭執；美國不承認中華人民共和國政府，主張由臺灣蔣介石政府參加和會，這遭到了蘇聯政府的堅決反對。眼看舊金山會議有擱淺的危險，美國為了早日實現其扶日**的目的，竟然置中國作為主要戰勝國的權益於不顧，藉口盟國對中國政府的認同有分歧而單方決定不邀請中國代表出席舊金山和會，主張中國應在會外與日本單獨締結和約，對於將由中國哪一方與日本締約，美國強調“應由日本去決定”。
這種把中國排除在對日和約談判之外並且給予日本選擇締約物件權利的做法，使中國在對日和約問題上失去了主動地位。中國海峽兩岸對美國無視中國權益的作法均表示了強烈的反對；蔣介石隨即中國被拒絕參加對日和約簽字，乃破壞國際信義之舉，政府決不容忍。
周恩來外長同樣代表新中國政府對此提出了抗議，指出舊金山召開的對日和約會議，背棄了國際義務，中國不予承認。
然而，美國當局不顧中國方面的強烈抗議，一意孤行召開了有五十二個國家出席的舊金山會議，並操縱會議透過了對日和約。
舊金山和約是很不公正的條約，它把對日作戰的起始時定為1941年12月7日，從而抹殺了中國人民自1931年9月18日起，特別是1937年7月7日至1941年12月7日這幾年對日寇的單獨抗擊的歷史。
同時，和約在賠償問題上極力寬大日本，只是泛泛地規定：“日本國對戰爭中造成的損害及痛苦，將向盟國支付賠償。”
對於具體數額根本沒有提及，同時對戰勝國的賠償要求作了原則上的限制：即只能“利用日本人民在製造上、打撈上及對各該盟國的貢獻的其他服務上的技能與勞作，作為協定賠償各國修復其所受損失的費用”，而且必須在“日本可以維持生存的經濟範圍內進行”。
這種重重限制的賠償規定就是以日本人的勞務充作賠償，實際上是變相減免日本的戰爭賠償，與1945年盟國賠償委員會作出的加重賠償的原則是相牴觸的。因而遭到了亞洲、歐洲正義國家的反對。除了中國、朝鮮、越南未被邀請赴會外，緬甸和印度拒絕出席會議，而出席會議的蘇聯、捷克斯洛伐克和波蘭會後拒絕簽字。這樣，由於中、印、蘇等國的抵制，當時世界上有一半的人口是不承認舊金山和約的。
第九百八十三章 賠償與審判（三）
可以說，歷史上的這次舊金山和會是美國單獨一手操縱的，其目的就是為了達到最終扶植日本，重新武裝日本這條看門狗的目的。
全新的中國人民重要政府同時宣告，“舊金山和約由於沒有中華人民共和國參加準備、擬製和簽訂，中央人民政府認為是非法的、無效的，因而是絕對不能承認的。”
極大地改善了日本戰後所處的不利地位，因而日本國會便非常痛快地批准了這個和約。與舊金山和約同樣給日本帶來好處的，即日本對於中日雙邊和約締結物件的選擇權。日本當時的首相吉田茂很興奮地宣佈：“日本現在有選擇媾和對手之權，對於如何行使此權，應考慮客觀環境，考慮中國情形以及其與日本將來之關係，不擬輕予決定。”
言下之意即日本一定要充分利用這一權利謀取最大的益處。事後證明，吉田政府的確在這個問題上絞盡腦汁，大做文章，極盡陰險、奸詐之能事。
為了等待時機，日本政府在與中國締和問題上採取了拖延的對策，但為了防止盟國指責它蓄意拖延，吉田政府煞費苦心地搞了一個民意測驗，讓日本國民就同北京還是臺北締結和約表態，但得出的結果卻令人哭笑不得：支援與臺北或北京締約的比例一模一樣，均為百分之三十八，而餘下的百分之二十四的國民則表