不管這次調查的結果如何，對斯普魯恩斯，大西洋艦隊，甚至是美國海軍而言，這絕對是一次巨大的打擊。首先這讓很多人意識到，總統不再信任海軍。其次，調查工作嚴重的影響到了大西洋艦隊的正常秩序。最後，這還嚴重分裂了大西洋艦隊，給部分有野心的參謀提供了表現的機會。特別是在傳訊了之前被斯普魯恩斯解除了職務的那幾名“謀反”的參謀之後，大西洋艦隊內部已經四分五裂，而且人心惶惶，還有哪個官兵會想到作戰行動呢？
連續好幾天，斯普魯恩斯都在接受各種各樣的詢問。除了他心底要保全大西洋艦隊的想法之外，他沒有隱瞞什麼，而且也沒有必要隱瞞什麼。說實話，當時負責調查的那幾個人都不是海軍軍官，對海軍又有多少了解呢？而且斯普魯恩斯在指揮艦隊作戰的時候，就已經考慮到會遭到調查，因此他在下達命令，部署作戰任務的時候都相當主意措詞。可是斯普魯恩斯忽略了一個問題，那就是大西洋艦隊不是他之前的第五艦隊，他的大部分親信參謀都沒有在這裡，那麼就不是所有的參謀都會站在他這一邊。
到了八月二十八日，調查人員查到了當初斯普魯恩斯趕走的那幾名參謀軍官，這也是整個調查的轉折點。在這幾個參謀軍官的供詞中，都提到斯普魯恩斯消極應戰。很快，好幾個受到單獨審問的參謀軍官的供詞也出現了漏洞。
到九月二日的時候，斯普魯恩斯受到了第六次傳訊，這也是持續時間最長的一次詢問。雖然調查人員很是客氣，但是卻提到了幾個極為關鍵的問題。比如，斯普魯恩斯在知道唐帝國的聯合艦隊將出現在巴哈馬群島南部海域之後，為什麼不積極迎戰，而是選擇了撤退。以及在被敵人的偵察機發現之後，為什麼沒有立即發動進攻，而是逃避。還有在隨後的行動中，大西洋艦隊為什麼改變了作戰安排，轉而離開了戰場，而不是南下進入加勒比海。面對這些問題，就算斯普魯恩斯早就有所準備，可也很難給出一致的答案，他的回答在很多地方都相互矛盾。
到這個時候，斯普魯恩斯已經是迴天乏力了。他是精明的指揮官，是戰術應用的高手，也是戰場上最明智的人，可他並不是陰謀家，也沒有策劃陰謀的那種天分。調查越深入，斯普魯恩斯在戰役中所採取的消極應戰的行動也就越明顯。到九月五日的時候，全面調查工作基本上結束。雖然調查委員會沒有權力決定將領與軍官應該受到什麼樣的懲罰，但是斯普魯恩斯當時就已經知道，他的海軍軍人生涯結束了。
美國總統是在九月七日的時候拿到了調查委員會對大西洋艦隊全面調查的第一份報告的。這份報告中有很多地方的措詞都相當強烈。可想而知，在總統把金上將叫到白宮，並且讓金上將看了調查報告之後，金上將會有什麼樣的反應。當時，金上將就提出了辭職，表示願意承擔大西洋艦隊的一切責任，很明顯，金上將不惜以辭職相威脅，以保護斯普魯恩斯。總統不可能接受金上將遞交的辭呈，因為沒有第二個人可以頂替金上將，無奈之下，總統只能命令調查委員會進行更深入的單獨調查。
當時，金上將沒有忘記另外一件事情，即古巴的地面戰鬥基本上已經結束，唐帝國陸戰隊沒有繼續發動進攻，而且在可以預見的兩到三個月之內，敵人也不會發動大規模的進攻，那麼就應該對陸軍在防禦聖地亞哥，以及古巴東南部地區的作戰行動也進行相應的全面調查。說白了，這就是禍水東引，只要在陸軍也查出了問題，那麼總統就不能把責任都推到海軍身上去，到時候，甚至不需要讓海軍來承擔主要責任，也就自然不會讓斯普魯恩斯離開大西洋艦隊了。
針對陸軍的調查是在九月九日開始的，佈雷德利被招了回來，而且還有上百名參謀，以及前線指揮官接到了傳訊。與大西洋艦隊的情況一樣，針對陸軍的調查工作也很是徹底，至少