軍事交流合作，總統府決定成立軍事處，與秘書廳並列為總統辦事機關，同時撤銷原軍事參議處，以便與國務院陸軍、海軍兩部對接。此外。保留原有的參謀本部，負責掌管全國國防用兵事宜、統轄全國參謀將校等要務，並擬由黃克強先生出任參謀總長。
“三是更新軍隊編制。武昌首義以來。各省軍隊編制皆是隨心所欲，或沿襲舊稱，或便宜編制，名稱有所謂光復團、規復團、國民軍、學生軍。也有巡防隊、偵察隊、禁衛隊、先鋒隊、巡警隊。還有水師、團練、敢死隊、尚武隊、挺身隊等，凡此種種不一而足。此等混亂編制，與國家統一、軍政統一之旨大相違背，必須儘快更新軍隊編制，使得全國劃一。
“四是解散冗餘軍隊。財政收入少而軍費龐大是當前最嚴重的一個問題，各省革命軍由於兵多餉少也難以維持下去。前些日子，南京留守黃克強先生就曾致電袁某，主張以大刀闊斧的手段進行裁兵工作。並建議舉辦國民捐作為裁兵經費。具體如何裁撤，還請國務院與總統府協商積極磋商。擬定一個各方都能接受的可行性章程，儘快頒佈實施，減輕國民負擔。
“五是停止購運槍械。購運槍械在軍餉中佔資比例最大，而中國只有北平鐵廠、漢陽鐵廠及江南製造局等幾家工廠生產槍支炮彈外，其他槍械都需向英、德、美、日等國購買，平白無故讓列強撈取無數好處。而且一省購買，周圍各省為了加強防衛也必須購買，從而形成軍備競賽，靡費更是不可勝計！現在既要釐清軍務，自然應該要求各省停止購運槍械，海關、稅司也將積極行動，提高稅額，扣押違規購運槍械。
“以上五點皆關乎國計民生，迫切需要早日解決。雖然總統府負責全國各項軍務，但如果由總統府出面擬定釐清軍務草案，難免會引人猜忌，以為袁某在藉機排除異己，削弱他方實力。所以不如由國務院先行商議拿出初稿，再交予總統府修改審定，最後頒諸全國。一則昭示府院之間合作無間，二則充分體現各方、各黨派的意願，免得有人秋後算賬。少川總理，你以為如何？”
唐紹儀微微點頭：“大總統所言頗為有理！要想實現完全的內閣責任制，避免軍人干政，儘快釐清軍務是勢在必行。關鍵問題是在釐清軍務過程中要公平公正，不分南北通盤考慮，避免激化矛盾，別軍務尚未釐清，又惹出一堆別的事端。”
袁世凱馬上把皮球踢了回來道：“這就是在座各位內閣成員需要周密考慮的問題了！”說完走下臺來，和唐紹儀握了握手：“少川總理，今天國務院剛剛成立，又要召開首次國務會議，只怕還有許多公務，袁某不敢過多打攪，就此告辭！”
唐紹儀殷切地挽留道：“大總統日理萬機，能夠撥冗前來參加成立典禮，內閣同仁歡喜無盡。還是再坐會吧？”
袁世凱道：“總統府也還有一堆瑣事需要處理，袁某實在不便久留。”然後衝在座眾人拱了拱手：“諸位總長，袁某先行告辭，以後國家事務就有勞諸位了！”
眾人連稱“不敢”，然後簇擁著把袁世凱送到門外，目送他登上來時的馬車。正在告別之際，突然聽見唐紹儀大聲說道：“智庵兄，等會兒還有國務會議，你是內務總長，不可或缺。怎麼現在就不辭而別？快請留步！”眾人急忙轉過頭，只見趙秉鈞正鑽進一輛馬車，顯然準備跟著袁世凱一同離去。
趙秉鈞聞聲探出頭來：“哦，鄙人和大總統還有些重要事務需要商議，就不參加國務會議了。”說完把頭縮排車廂再不出聲，接著便在衛兵的拱衛之下隨同袁世凱離開了國務院，只剩下一干人等在門口大眼瞪小眼。
半晌，宋教仁整了整領帶，轉身對唐紹儀說道：“少川總理，既然不可或缺的人已經離場，那國務會議是不是就暫時不開了？既然如此。宋某先行告退！”說罷不待唐紹儀挽留，便揚長而去