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遏必隆凡事附和鰲拜，索尼老邁，身體不好，一向不大管事。加上琬瀠毫不干涉，蘇克薩哈孤掌難鳴逐漸被排擠出權利中心，怏怏不樂，只能自行請辭，更是被鰲拜提議去給先帝守陵。蘇克薩哈本來打算暫且隱退，避其鋒芒，以圖復出，只是日益驕恣的鰲拜不給他任何機會，窮追猛打。藉機羅織二十四項罪狀，上奏請將蘇克薩哈和他的長子查克旦腰斬，其餘子孫處死，抄沒家產。琬瀠不準。鰲拜又再次上書，琬瀠見時機成熟，道：“鰲拜，蘇克薩哈是先帝指定的輔政大臣之一，便是有罪，何至於此？”鰲拜自然辯解，琬瀠又道：“何況，你與蘇克薩哈為兒女姻親，卻提議處死他的兒孫。如此手段，豈能不讓人膽寒。”
然後乾坤獨斷，賜蘇克薩哈毒酒一杯，罷免其子官職，不累及其他兒孫。至此鰲拜的名聲更壞，便是依附他的人也忍不住想，鰲拜對自己的親生女兒和外孫尚且如此，何況自己這些後來才投靠他的人呢？蘇克薩哈的死，除去了琬瀠的一塊心病，更是把四輔臣拉下神壇。本來四輔臣有順治欽定，不管實權如何，地位都甚為尊崇。但是蘇克薩哈議罪無疑告示了，四輔臣並沒有免死金牌，犯了過錯一樣要接受懲罰。雖然琬瀠放過了蘇克薩哈的黨羽，但是樹倒猢猻散，再說還有鰲拜代勞不是。
康熙七年，為順治的孝陵建造了神功聖德碑。琬瀠心中覺得諷刺，不論孝莊這個人如何，順治對親生母親的態度都算不上好，但是他的陵寢竟然定為孝陵。不得不說，為尊者諱，古今皆同。又下令為順治編修《世祖實錄》。加封加鰲拜、遏必隆太師。看著鰲拜朗聲大笑，一副應該如此的樣子，暗罵一句，真是利令智昏，鰲拜以前也沒有這樣看不清形勢。加封太師，已經是人臣榮耀的極點了。一個臣子，到了封無可封的地步，只知沾沾自喜，毫不知居安思危，也須是怪不得自己對他下手。
琬瀠喚來玄燁道：“我兒，鰲拜這廝跋扈囂張，儼然有一代權臣之象，實不必再留。這便是額娘交給你的第一個歷練，清除鰲拜的勢力，讓額娘看看我兒的手段如何。”對於朝政，玄燁大部分時候都是聽琬瀠分析，如今有機會實幹一場，十分激動，至此逐漸在朝會上發言，和鰲拜爭執不斷。琬瀠對此並不表態，淡看玄燁和鰲拜二人鬥法。鰲拜對此並沒有提高警惕，只當康熙是少年心性，爭強好勝，不如皇太后思慮周全。
就在這一年，琬瀠結束了長達多年的歷法之爭。後世把這件事情看做鰲拜及其黨羽失勢的開始。曆法之爭可以說是有鰲拜一手發起的，針對湯若望和南懷仁等西洋教士，進行了一系列的迫害。二月的時候，琬瀠命令南懷仁推算曆法，並帶著玄燁巡視京畿直隸等地。“本宮就是要讓天下人知道，誰才是江山的主人，不是已經死去的蘇克薩哈，更不會是活著的鰲拜”琬瀠這樣和米思翰說，並且命其全權負責出行的安全事宜。一個月後歸來，授南懷仁為欽天監監副。此舉大大掃了鰲拜的顏面。只是蘇克薩哈已死，琬瀠目的達成，下一步便是要收拾鰲拜，自然不會像之前那樣縱然他跋扈的行為。
剷除鰲拜集團，是玄燁一手策劃並實施的。一日，玄燁前來回稟琬瀠，想要挑選幾個親貴子弟在宮中練習布庫。琬瀠瞭然一笑，佈局開始了。遂應允了玄燁的請求。且不說鰲拜雖然表面上權勢赫赫，但實際遠不如歷史上一代權臣有著轄制君王那樣的實力。這些親貴子弟，出身不凡，正當年少，初生牛犢不怕虎，哪裡管他鰲拜如何勇武不凡、權勢赫赫呢？玄燁以嬉戲為名，訓練了一段時間，是他們紀律嚴明，聽從自己的指揮。由訊息傳出宮務，只是說皇上最近迷上了摔跤。練習摔跤可以強身健體，國事有皇太后處理，皇帝畢竟年幼，一時愛玩也是有的，大臣們並不懷疑。鰲拜更是覺得皇帝不愧是還小，前一階段和自己針鋒相對應該也是無心。
五月份，琬